298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3005 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
411 aa  801    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  43.47 
 
 
424 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  43.97 
 
 
398 aa  263  4e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  38.64 
 
 
415 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  41.08 
 
 
407 aa  237  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  38.52 
 
 
399 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  40.82 
 
 
372 aa  210  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  41.85 
 
 
400 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  39.3 
 
 
402 aa  203  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  36.92 
 
 
424 aa  202  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  41.93 
 
 
374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  40.32 
 
 
400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  39.77 
 
 
393 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  38.17 
 
 
402 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  38.82 
 
 
400 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  38.82 
 
 
400 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  38.82 
 
 
400 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  38.07 
 
 
404 aa  186  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  41.54 
 
 
396 aa  179  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  40.29 
 
 
393 aa  179  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  36.86 
 
 
371 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  36.66 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  35.9 
 
 
377 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  33.51 
 
 
402 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  30.11 
 
 
372 aa  170  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  35.29 
 
 
384 aa  170  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  35.18 
 
 
380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  33.43 
 
 
390 aa  160  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  35.04 
 
 
394 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  36.71 
 
 
391 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  37.89 
 
 
389 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  32.93 
 
 
370 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  33.53 
 
 
388 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  36.39 
 
 
403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  37.23 
 
 
388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  34.72 
 
 
398 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  34.91 
 
 
403 aa  145  9e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  37.99 
 
 
371 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  35.31 
 
 
408 aa  144  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  34.04 
 
 
386 aa  143  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  32.09 
 
 
397 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  31.15 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  31.59 
 
 
423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  31.44 
 
 
467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  34.92 
 
 
400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  29.7 
 
 
396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  29.85 
 
 
418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 
413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  32.58 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  29.77 
 
 
496 aa  109  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  30.94 
 
 
381 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  29.47 
 
 
388 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  29.79 
 
 
434 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  31.5 
 
 
405 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  30.81 
 
 
388 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  31.92 
 
 
395 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  28.18 
 
 
373 aa  96.3  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  29.14 
 
 
351 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  30.56 
 
 
392 aa  89.7  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  32.23 
 
 
393 aa  89.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  28.74 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  27.57 
 
 
404 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  28.14 
 
 
422 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  28.15 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  27.57 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  27.01 
 
 
404 aa  72.4  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  28.14 
 
 
404 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  27.81 
 
 
402 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  25.71 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  25.71 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  30.72 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  27.86 
 
 
399 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  29.06 
 
 
374 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  25.63 
 
 
396 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  29.01 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  30.38 
 
 
411 aa  68.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  24.32 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  27.74 
 
 
374 aa  67  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  23.68 
 
 
376 aa  67  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  30.46 
 
 
379 aa  65.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  25.42 
 
 
385 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  27.16 
 
 
388 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  27.44 
 
 
414 aa  64.3  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  29.72 
 
 
382 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  27.33 
 
 
364 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  26.99 
 
 
405 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5376  hypothetical protein  30.1 
 
 
438 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  28.92 
 
 
376 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  21.32 
 
 
374 aa  63.2  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  25.95 
 
 
402 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  21.32 
 
 
374 aa  63.2  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  25.6 
 
 
397 aa  63.2  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  27.33 
 
 
364 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  24.6 
 
 
385 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  25.97 
 
 
397 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  26.71 
 
 
387 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09700  putative monooxygenase  29.97 
 
 
401 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000279069  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  30.38 
 
 
387 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  27.19 
 
 
360 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  30.15 
 
 
486 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>