More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2989 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2501  Glycine hydroxymethyltransferase  76.83 
 
 		 427 aa  655    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2989  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 440 aa  883    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0694  serine hydroxymethyltransferase  79.21 
 
 		 429 aa  682    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27940  serine hydroxymethyltransferase  78.14 
 
 		 430 aa  685    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.958283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1189  serine hydroxymethyltransferase  77.54 
 
 		 432 aa  650    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000045975 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11114  serine hydroxymethyltransferase  76.54 
 
 		 426 aa  640    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000666035  normal  0.472146 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1663  Glycine hydroxymethyltransferase  75.7 
 
 		 435 aa  663    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1115  serine hydroxymethyltransferase  77.51 
 
 		 435 aa  644    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234213  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0754  Glycine hydroxymethyltransferase  80.85 
 
 		 428 aa  690    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128225  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3130  Glycine hydroxymethyltransferase  75 
 
 		 432 aa  633  1e-180  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04680  serine hydroxymethyltransferase  72.18 
 
 		 426 aa  615  1e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21370  serine hydroxymethyltransferase  74.23 
 
 		 422 aa  609  1e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.100651  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3981  Glycine hydroxymethyltransferase  75 
 
 		 434 aa  604  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.638114 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0767  serine hydroxymethyltransferase  68.4 
 
 		 445 aa  595  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0535  Glycine hydroxymethyltransferase  69.34 
 
 		 434 aa  593  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2353  serine hydroxymethyltransferase  72.34 
 
 		 423 aa  585  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0383526  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0424  Glycine hydroxymethyltransferase  70.99 
 
 		 422 aa  579  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13350  serine hydroxymethyltransferase  71.05 
 
 		 423 aa  575  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2884  Glycine hydroxymethyltransferase  69.07 
 
 		 442 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10070  serine hydroxymethyltransferase  68.25 
 
 		 425 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.9411  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3596  Glycine hydroxymethyltransferase  71.46 
 
 		 447 aa  571  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3847  Glycine hydroxymethyltransferase  69.54 
 
 		 420 aa  566  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0657  Glycine hydroxymethyltransferase  68.72 
 
 		 452 aa  561  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3705  serine hydroxymethyltransferase  66.51 
 
 		 453 aa  552  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18800  serine hydroxymethyltransferase  69.23 
 
 		 412 aa  548  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4629  Glycine hydroxymethyltransferase  65.48 
 
 		 430 aa  540  9.999999999999999e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0469  serine hydroxymethyltransferase  63.27 
 
 		 474 aa  525  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996315  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5659  Glycine hydroxymethyltransferase  68.56 
 
 		 421 aa  521  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  59.47 
 
 		 427 aa  482  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  58.27 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  57.25 
 
 		 415 aa  479  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  59.38 
 
 		 431 aa  480  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  56.07 
 
 		 411 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  55.83 
 
 		 411 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  56.7 
 
 		 425 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  56.7 
 
 		 425 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  57.75 
 
 		 432 aa  472  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  58.57 
 
 		 419 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  54.96 
 
 		 412 aa  473  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 		 424 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  55.13 
 
 		 435 aa  471  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  56.55 
 
 		 434 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  57.25 
 
 		 417 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  58.37 
 
 		 429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  56.83 
 
 		 416 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  56.49 
 
 		 415 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  58.37 
 
 		 415 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  56.55 
 
 		 434 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  55.29 
 
 		 413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  55.42 
 
 		 413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  56.13 
 
 		 431 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  56.49 
 
 		 415 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  55.66 
 
 		 431 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  56.52 
 
 		 411 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  57.89 
 
 		 420 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  56.13 
 
 		 431 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  57.31 
 
 		 432 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  56.95 
 
 		 433 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  55.45 
 
 		 417 aa  466  9.999999999999999e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  55.34 
 
 		 418 aa  467  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  55.86 
 
 		 434 aa  463  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  56.76 
 
 		 412 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  56.19 
 
 		 420 aa  464  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6203  serine hydroxymethyltransferase  59.02 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0377267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  55.77 
 
 		 415 aa  463  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  53.96 
 
 		 423 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  54.5 
 
 		 416 aa  462  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  56.83 
 
 		 417 aa  464  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  55.81 
 
 		 430 aa  463  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  56.8 
 
 		 413 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  57.31 
 
 		 417 aa  463  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  55.77 
 
 		 415 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  53.96 
 
 		 413 aa  461  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  54.09 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  53.86 
 
 		 412 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4649  serine hydroxymethyltransferase  57.31 
 
 		 434 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.863224  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  55.66 
 
 		 412 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1438  glycine hydroxymethyltransferase  56.16 
 
 		 421 aa  458  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  56.73 
 
 		 417 aa  458  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  54.87 
 
 		 415 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  56.57 
 
 		 440 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 433 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  53.72 
 
 		 413 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  54.46 
 
 		 423 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1649  serine hydroxymethyltransferase  58.29 
 
 		 434 aa  460  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  56.07 
 
 		 417 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  53.72 
 
 		 413 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  57.55 
 
 		 417 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71460  serine hydroxymethyltransferase  58.54 
 
 		 417 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  54.2 
 
 		 414 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  53.72 
 
 		 413 aa  458  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2477  serine hydroxymethyltransferase  55.8 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  53.48 
 
 		 414 aa  456  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  53.72 
 
 		 414 aa  458  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  54.02 
 
 		 431 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  57.07 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  54.07 
 
 		 416 aa  458  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  55.19 
 
 		 431 aa  456  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  56.2 
 
 		 415 aa  455  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  55.05 
 
 		 413 aa  457  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>