104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2879 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
421 aa  822    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  59.1 
 
 
423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.14 
 
 
449 aa  402  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  51.46 
 
 
430 aa  376  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  49.89 
 
 
462 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  49.51 
 
 
427 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  44.77 
 
 
437 aa  362  8e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  49.63 
 
 
418 aa  354  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  48.58 
 
 
421 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  44.31 
 
 
448 aa  352  8.999999999999999e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.32 
 
 
417 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  44.91 
 
 
413 aa  333  4e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  49.28 
 
 
424 aa  331  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  48.53 
 
 
418 aa  317  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  44.68 
 
 
446 aa  310  2e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  44.79 
 
 
429 aa  298  1e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  32.32 
 
 
435 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  31.76 
 
 
460 aa  160  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  32.3 
 
 
437 aa  159  9e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  27.88 
 
 
412 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  32.89 
 
 
437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  30.48 
 
 
441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  29.44 
 
 
434 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  30.49 
 
 
433 aa  145  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  32.79 
 
 
438 aa  145  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.48 
 
 
409 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  30.28 
 
 
427 aa  143  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  29.65 
 
 
425 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  29.26 
 
 
429 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  31.47 
 
 
438 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  29.74 
 
 
469 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  31.67 
 
 
473 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  31.89 
 
 
470 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  28.12 
 
 
423 aa  132  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  28.93 
 
 
432 aa  131  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  27.76 
 
 
411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  28.88 
 
 
440 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  26.73 
 
 
415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  23.74 
 
 
434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  23.79 
 
 
437 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  23.29 
 
 
438 aa  116  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  23.52 
 
 
437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  23.06 
 
 
437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  28.64 
 
 
417 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  27.12 
 
 
439 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  29.09 
 
 
447 aa  113  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  23.18 
 
 
437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  24.19 
 
 
437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  24.42 
 
 
437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  26.02 
 
 
464 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  23.84 
 
 
437 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  23.84 
 
 
437 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  24.07 
 
 
437 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  28.11 
 
 
424 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  39.77 
 
 
428 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  25.42 
 
 
415 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  25.18 
 
 
415 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  29.22 
 
 
475 aa  102  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  27.39 
 
 
445 aa  98.2  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  37.29 
 
 
436 aa  91.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  36.16 
 
 
437 aa  90.5  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  40.15 
 
 
452 aa  87.4  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  30.17 
 
 
466 aa  87  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  25.8 
 
 
478 aa  87  6e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  38.17 
 
 
439 aa  84.3  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.77 
 
 
445 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.160228 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  26.77 
 
 
574 aa  80.1  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  26.17 
 
 
556 aa  79.3  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  32.78 
 
 
442 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  35.06 
 
 
464 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  31.82 
 
 
486 aa  67.4  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.14 
 
 
454 aa  67  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.15 
 
 
504 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  29.7 
 
 
572 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  28.02 
 
 
483 aa  59.7  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  39.53 
 
 
376 aa  57.4  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  27.43 
 
 
366 aa  53.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  27.91 
 
 
761 aa  51.6  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3577  FAD linked oxidase-like  27.88 
 
 
495 aa  50.8  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.310441  normal  0.085604 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  25 
 
 
425 aa  50.8  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  32.28 
 
 
753 aa  50.4  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  23.5 
 
 
444 aa  50.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  30.86 
 
 
462 aa  49.3  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02835  conserved hypothetical protein  26.97 
 
 
436 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.789204  normal  0.0228764 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.06 
 
 
433 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  31.14 
 
 
455 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  23.49 
 
 
471 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  23.4 
 
 
457 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  23.4 
 
 
457 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  23.49 
 
 
478 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  23.49 
 
 
478 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  20.42 
 
 
475 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  23.49 
 
 
468 aa  47  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  23.49 
 
 
478 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  23.49 
 
 
471 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  18.61 
 
 
481 aa  47  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.41 
 
 
453 aa  46.6  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  33.13 
 
 
452 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.82 
 
 
490 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  30.15 
 
 
752 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>