More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2833 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2833  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
319 aa  627  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0200859  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.99 
 
 
316 aa  346  3e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
326 aa  312  3.9999999999999997e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
308 aa  219  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.56 
 
 
309 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.73 
 
 
310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27700  permease component of ABC-type sugar transporter  39.43 
 
 
321 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.479477 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.74 
 
 
294 aa  187  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
306 aa  185  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  37.18 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.18 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
309 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283647  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29330  permease component of ABC-type sugar transporter  36.86 
 
 
321 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
299 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 
318 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949955  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 
316 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal  0.915782 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  35.35 
 
 
320 aa  175  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 
307 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.21 
 
 
318 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0625824  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
309 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
313 aa  172  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34 
 
 
317 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1529  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
318 aa  172  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165529  normal  0.149292 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29020  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.04 
 
 
275 aa  172  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.37 
 
 
317 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000449996 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
310 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.498676  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2545  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
316 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.637107  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
305 aa  169  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99861  hitchhiker  0.000381845 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
297 aa  169  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1290  ABC transporter, permease protein  32.45 
 
 
311 aa  169  6e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
307 aa  169  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 
353 aa  169  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
315 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0308401  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11610  permease component of ABC-type sugar transporter  35.1 
 
 
311 aa  168  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.117578  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
308 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.48209 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  33.71 
 
 
287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.88 
 
 
309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
292 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
316 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.028536  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
300 aa  165  9e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
293 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990678  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.12 
 
 
318 aa  162  6e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000473727  hitchhiker  0.00124128 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
310 aa  162  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8235  ABC transporter, permease protein  35.57 
 
 
306 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.03 
 
 
317 aa  162  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.10809  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
319 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128042  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
316 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.264329 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
291 aa  161  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0196347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  35.59 
 
 
288 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1182  sugar ABC transporter, permease protein, putative  37.4 
 
 
319 aa  159  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547049  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
314 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000200699  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  35.84 
 
 
305 aa  160  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2010  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  31.97 
 
 
318 aa  159  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.360583  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
306 aa  159  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0472746 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1085  putative sugar ABC transporter, permease protein  37.4 
 
 
319 aa  159  6e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.89 
 
 
325 aa  159  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
293 aa  159  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
320 aa  159  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230008  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
292 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.824779  normal  0.0156091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
292 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
317 aa  158  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
317 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21160  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.92 
 
 
314 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103465  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
305 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.371496  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
292 aa  158  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6585  lactose transport system (permease)  36.95 
 
 
306 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
315 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0176  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.97 
 
 
314 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1100  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
300 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
306 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.49 
 
 
315 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0640497  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
317 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0473972  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12077  sugar ABC transporter membrane protein  34.15 
 
 
300 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
313 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000239391  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
283 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
292 aa  157  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
292 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.153616  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.37 
 
 
317 aa  157  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.37513  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 
312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.633875  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.205507 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.12 
 
 
313 aa  156  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05430  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.62 
 
 
321 aa  155  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0550121  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.13 
 
 
306 aa  155  9e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000185658  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0630  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  32.33 
 
 
310 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0604  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  32.33 
 
 
310 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3250  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  35.34 
 
 
310 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0698  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  32.33 
 
 
310 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 
296 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
319 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.491906  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
298 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  31.13 
 
 
318 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  31.91 
 
 
315 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.12 
 
 
310 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181942  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
314 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00699527 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
298 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00881  ABC transporter sugar permease  32.17 
 
 
294 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0244413  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>