33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2756 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2756  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  213  5.9999999999999996e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2641  hypothetical protein  65.66 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31480  hypothetical protein  65.93 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1759  hypothetical protein  56.07 
 
 		 113 aa  107  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048485  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3362  hypothetical protein  48.81 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.0980345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3214  cupin 2 domain-containing protein  46.88 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  37.86 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  45.65 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4174  hypothetical protein  36.89 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257816  normal  0.271179 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0496  hypothetical protein  39.58 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  40.86 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  43.48 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.18 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.94 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4297  hypothetical protein  41.24 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.94 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  38.83 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  41.41 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  39.8 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  40.86 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  38.14 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  38.14 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  38.14 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3698  hypothetical protein  39.81 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06690  hypothetical protein  38.2 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  42.47 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0275  hypothetical protein  33.64 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  33.64 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.75 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1814  hypothetical protein  38.04 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  37.68 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0363  hypothetical protein  31.76 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.540367  normal  0.422558 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  34.57 
 
 		 111 aa  40  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>