More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2707 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  100 
 
 
201 aa  395  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  69.65 
 
 
201 aa  280  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  69.65 
 
 
201 aa  280  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  69.65 
 
 
201 aa  280  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  71.64 
 
 
207 aa  280  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  68.16 
 
 
201 aa  267  7e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01310  methyltransferase family protein  66.17 
 
 
201 aa  267  8e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4890  methyltransferase type 12  68.18 
 
 
201 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.909319  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3591  methyltransferase type 12  64.14 
 
 
201 aa  248  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5057  Methyltransferase type 12  67.16 
 
 
201 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3347  methyltransferase type 12  64.14 
 
 
201 aa  241  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.84561  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  61.62 
 
 
199 aa  241  6e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  61.54 
 
 
423 aa  231  6e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2672  LigA  61.31 
 
 
200 aa  217  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3123  MCP methyltransferase, CheR-type  60.94 
 
 
198 aa  210  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000131582  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  55.38 
 
 
200 aa  194  6e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14310  methyltransferase family protein  50 
 
 
203 aa  182  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000424047  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  53.57 
 
 
205 aa  179  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4368  Methyltransferase type 12  49.72 
 
 
192 aa  156  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2432  methyltransferase type 11  41.67 
 
 
259 aa  128  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  43.33 
 
 
195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  40.65 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
219 aa  68.2  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  34.36 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  36.18 
 
 
304 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
249 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  40.57 
 
 
244 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  39.05 
 
 
246 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 
252 aa  63.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
237 aa  62.8  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  33.11 
 
 
217 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 
210 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  40.19 
 
 
265 aa  61.6  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  30 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  32.67 
 
 
209 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  31.78 
 
 
541 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  33.1 
 
 
263 aa  59.7  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 
254 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  36.04 
 
 
246 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 
208 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.98 
 
 
236 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  28.41 
 
 
235 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.98 
 
 
238 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35.77 
 
 
222 aa  58.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.84 
 
 
224 aa  58.5  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 
225 aa  58.2  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.38 
 
 
257 aa  58.2  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.30188 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
243 aa  57.8  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
257 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  29.2 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 
252 aa  57.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  34.58 
 
 
996 aa  57.8  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2249  methyltransferase type 12  25.56 
 
 
217 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.200806 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3312  hypothetical protein  28.19 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  28.07 
 
 
266 aa  57  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  32.59 
 
 
258 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  23.95 
 
 
215 aa  56.6  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  35.4 
 
 
254 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2738  glycosyl transferase, group 1  34.21 
 
 
540 aa  57.4  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  28.98 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
224 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  28.45 
 
 
206 aa  57.4  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  34.26 
 
 
244 aa  56.6  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 
305 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  30.21 
 
 
264 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  35.46 
 
 
218 aa  56.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.54 
 
 
227 aa  56.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  30.84 
 
 
541 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  34.01 
 
 
208 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  31.49 
 
 
220 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  30.84 
 
 
541 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  31.51 
 
 
258 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.38 
 
 
222 aa  55.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  38.33 
 
 
246 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  30.84 
 
 
541 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  25.32 
 
 
250 aa  55.5  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.38 
 
 
222 aa  55.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  30.84 
 
 
541 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
262 aa  55.5  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  24.29 
 
 
249 aa  55.1  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
218 aa  54.7  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  35.88 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
238 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  39.82 
 
 
232 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  25.87 
 
 
390 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  41.59 
 
 
291 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
267 aa  53.9  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  28 
 
 
237 aa  53.9  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  34.19 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  27.87 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
575 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  29.91 
 
 
247 aa  53.5  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0586  Methyltransferase type 12  37.5 
 
 
239 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2169  hypothetical protein  37.93 
 
 
223 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  27.74 
 
 
296 aa  52.8  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 
301 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  33.94 
 
 
253 aa  52.8  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1814  methyltransferase type 12  23.94 
 
 
263 aa  53.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>