More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2697 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 910 aa  1716    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  44.76 
 
 		 913 aa  598  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  38.85 
 
 		 919 aa  372  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 928 aa  365  3e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  37.75 
 
 		 909 aa  362  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  38.52 
 
 		 884 aa  350  6e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  38.51 
 
 		 913 aa  313  9e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  37.89 
 
 		 938 aa  313  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  37.33 
 
 		 879 aa  306  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  33.44 
 
 		 925 aa  298  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  36.12 
 
 		 940 aa  292  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  35.08 
 
 		 905 aa  281  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  36.12 
 
 		 920 aa  271  5e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  33.15 
 
 		 927 aa  269  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  32.79 
 
 		 917 aa  264  6e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  32.7 
 
 		 995 aa  258  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  37.65 
 
 		 946 aa  243  9e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  33.48 
 
 		 936 aa  234  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  33.72 
 
 		 929 aa  227  8e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  32.93 
 
 		 923 aa  222  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  32.64 
 
 		 919 aa  218  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  35.98 
 
 		 915 aa  212  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  35.04 
 
 		 928 aa  197  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  39.69 
 
 		 930 aa  194  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  31.03 
 
 		 923 aa  190  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  31.03 
 
 		 977 aa  189  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  37.53 
 
 		 916 aa  189  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  40.42 
 
 		 940 aa  188  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  41.84 
 
 		 903 aa  183  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  40.79 
 
 		 894 aa  171  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  35.61 
 
 		 922 aa  169  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  37.53 
 
 		 955 aa  160  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  35.4 
 
 		 923 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 929 aa  158  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 937 aa  158  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  37.79 
 
 		 937 aa  158  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  37.9 
 
 		 934 aa  156  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  37.56 
 
 		 937 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  39.39 
 
 		 961 aa  149  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 919 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  33.63 
 
 		 919 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  33.63 
 
 		 919 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 881 aa  134  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  35.25 
 
 		 918 aa  134  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 881 aa  134  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  35.6 
 
 		 884 aa  130  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 876 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  38.28 
 
 		 913 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  44.59 
 
 		 911 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  37.87 
 
 		 1064 aa  113  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  51.02 
 
 		 904 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  37.67 
 
 		 240 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  32 
 
 		 835 aa  110  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 950 aa  107  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  36.06 
 
 		 919 aa  107  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  35.14 
 
 		 927 aa  105  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 889 aa  103  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  40.59 
 
 		 959 aa  102  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  30.8 
 
 		 923 aa  100  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  29.95 
 
 		 927 aa  100  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  36.22 
 
 		 893 aa  97.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  39.33 
 
 		 189 aa  97.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  35.92 
 
 		 929 aa  95.1  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  47.01 
 
 		 928 aa  94  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  38.89 
 
 		 921 aa  94  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  28.02 
 
 		 918 aa  93.6  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 921 aa  93.6  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  38.89 
 
 		 921 aa  93.6  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  38.55 
 
 		 921 aa  92  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 894 aa  90.1  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  51.55 
 
 		 953 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 998 aa  87.8  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  38.62 
 
 		 910 aa  87.4  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  41.81 
 
 		 946 aa  86.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  32.31 
 
 		 997 aa  85.5  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  39.15 
 
 		 932 aa  83.2  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 1000 aa  82.4  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  46.72 
 
 		 892 aa  82  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  29.93 
 
 		 953 aa  82  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  34.58 
 
 		 900 aa  81.3  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  29.41 
 
 		 1006 aa  79.7  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 877 aa  79.7  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  29.41 
 
 		 974 aa  79  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 947 aa  78.6  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  35.79 
 
 		 897 aa  74.7  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 895 aa  73.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  51.04 
 
 		 960 aa  73.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  46.96 
 
 		 947 aa  73.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 1030 aa  72  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  26.39 
 
 		 1029 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  34.95 
 
 		 952 aa  68.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 951 aa  68.6  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  29.89 
 
 		 1075 aa  67.4  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  26.96 
 
 		 1050 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.96 
 
 		 1050 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 1085 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  41.73 
 
 		 981 aa  66.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 1137 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  40.2 
 
 		 956 aa  64.7  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>