More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2594 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  57.24 
 
 
603 aa  650    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
608 aa  1219    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  60.73 
 
 
606 aa  706    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  59.2 
 
 
600 aa  688    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  56.36 
 
 
622 aa  644    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  60.23 
 
 
606 aa  685    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  60.43 
 
 
606 aa  672    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  58.96 
 
 
606 aa  664    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  65.22 
 
 
599 aa  764    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  63.83 
 
 
604 aa  754    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  67.73 
 
 
602 aa  776    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  55.52 
 
 
599 aa  628  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  54.79 
 
 
602 aa  615  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  55.5 
 
 
605 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  54.59 
 
 
616 aa  613  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  52.74 
 
 
602 aa  612  9.999999999999999e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  53.9 
 
 
619 aa  607  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  53.8 
 
 
593 aa  600  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  55.38 
 
 
600 aa  593  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.75 
 
 
597 aa  588  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  52.14 
 
 
599 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  52.67 
 
 
599 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  51.25 
 
 
598 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  51.67 
 
 
599 aa  565  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  51.32 
 
 
599 aa  565  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  49.83 
 
 
611 aa  561  1e-158  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  49.08 
 
 
597 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  49.08 
 
 
597 aa  554  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  49.08 
 
 
597 aa  554  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  49.67 
 
 
597 aa  549  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  48.34 
 
 
601 aa  545  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  49.16 
 
 
595 aa  542  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  49.67 
 
 
600 aa  542  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  48.42 
 
 
607 aa  540  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  47.54 
 
 
602 aa  540  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  49.74 
 
 
601 aa  538  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  47.33 
 
 
602 aa  536  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  44.52 
 
 
603 aa  537  1e-151  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  48.38 
 
 
615 aa  532  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  50.33 
 
 
599 aa  533  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1204  AMP-dependent synthetase and ligase  49.43 
 
 
609 aa  532  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  49.38 
 
 
600 aa  529  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1274  AMP-dependent synthetase and ligase  47.32 
 
 
609 aa  527  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000455356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  49.5 
 
 
604 aa  521  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  47.32 
 
 
591 aa  518  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  49.42 
 
 
596 aa  515  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  50.81 
 
 
615 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  46.62 
 
 
606 aa  510  1e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  46.62 
 
 
597 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  45.94 
 
 
597 aa  497  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  45.22 
 
 
618 aa  496  1e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  48.03 
 
 
612 aa  489  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  47.93 
 
 
632 aa  486  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  46.99 
 
 
612 aa  484  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  43.22 
 
 
679 aa  479  1e-134  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  45.93 
 
 
607 aa  476  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0401  long-chain acyl-CoA synthetase  42.78 
 
 
701 aa  451  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  41.54 
 
 
606 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0592  long-chain acyl-CoA synthetase  40.5 
 
 
677 aa  410  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  41.03 
 
 
606 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 
605 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  41.4 
 
 
606 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  41.69 
 
 
607 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0860  AMP-binding enzyme  40.69 
 
 
682 aa  405  1e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0944  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 
622 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1932  AMP-dependent synthetase and ligase  44.8 
 
 
590 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333973  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  39.54 
 
 
604 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  39.54 
 
 
604 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  37.54 
 
 
594 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  36.27 
 
 
607 aa  384  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  38.88 
 
 
604 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  38.52 
 
 
622 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  38.25 
 
 
649 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  37.9 
 
 
617 aa  379  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 
609 aa  372  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  35.38 
 
 
610 aa  368  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  34.79 
 
 
597 aa  364  3e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  35.91 
 
 
633 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  35.1 
 
 
598 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  37.71 
 
 
610 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  36.52 
 
 
633 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  35.83 
 
 
612 aa  356  5e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  33.28 
 
 
587 aa  356  7.999999999999999e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 
610 aa  355  1e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 
610 aa  353  5e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 
603 aa  353  7e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  35.1 
 
 
610 aa  351  2e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  33.28 
 
 
610 aa  350  4e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  36.14 
 
 
669 aa  349  1e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  33.28 
 
 
607 aa  348  2e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  34.16 
 
 
590 aa  347  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 
652 aa  345  1e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  36.83 
 
 
602 aa  343  4e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  35.15 
 
 
603 aa  343  7e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  33.86 
 
 
592 aa  338  1.9999999999999998e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 
602 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 
602 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 
602 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3960  AMP-dependent synthetase and ligase  37.36 
 
 
635 aa  336  9e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.522834  normal  0.0456544 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  34.93 
 
 
613 aa  335  1e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>