More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2593 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  70.87 
 
 		 916 aa  1250    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  61.83 
 
 		 860 aa  1054    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  63.07 
 
 		 861 aa  1055    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  74.35 
 
 		 886 aa  1284    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  65.13 
 
 		 881 aa  1110    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  62.6 
 
 		 858 aa  1039    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  66.08 
 
 		 836 aa  1068    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  57.79 
 
 		 872 aa  988    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123734 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  60.68 
 
 		 911 aa  1097    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1314  valyl-tRNA synthetase  63.59 
 
 		 903 aa  1074    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  66.75 
 
 		 846 aa  1093    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  64.46 
 
 		 845 aa  1054    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0019  valyl-tRNA synthetase  61.57 
 
 		 862 aa  1043    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.661225 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  71.4 
 
 		 901 aa  1230    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 855 aa  848    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  72.88 
 
 		 906 aa  1314    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  63.53 
 
 		 885 aa  1075    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  64.57 
 
 		 876 aa  1090    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  59.69 
 
 		 925 aa  1081    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  57.54 
 
 		 873 aa  1001    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2593  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 902 aa  1815    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09690  valyl-tRNA synthetase  60.02 
 
 		 895 aa  1058    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  62.05 
 
 		 871 aa  1029    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  65.12 
 
 		 877 aa  1093    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  59.42 
 
 		 894 aa  1023    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 		 864 aa  569  1e-161  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 		 802 aa  570  1e-161  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  35.33 
 
 		 808 aa  572  1e-161  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  36.6 
 
 		 896 aa  512  1e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 928 aa  508  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 		 892 aa  480  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 		 905 aa  475  1e-132  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 		 908 aa  472  1.0000000000000001e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 		 863 aa  446  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  33.21 
 
 		 865 aa  443  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 865 aa  442  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 		 855 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 		 864 aa  437  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  30.61 
 
 		 886 aa  437  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  29.74 
 
 		 906 aa  430  1e-119  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  30.64 
 
 		 886 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  33.69 
 
 		 863 aa  428  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  30.49 
 
 		 886 aa  429  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 		 886 aa  423  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 		 865 aa  421  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 		 869 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  31.61 
 
 		 858 aa  408  1.0000000000000001e-112  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 809 aa  388  1e-106  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 		 799 aa  379  1e-104  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  32.88 
 
 		 799 aa  377  1e-103  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 		 799 aa  370  1e-101  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  31.88 
 
 		 799 aa  369  1e-100  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 		 806 aa  355  2.9999999999999997e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  29.59 
 
 		 808 aa  345  2e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 		 771 aa  340  7e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 		 816 aa  339  9.999999999999999e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0603  putative valyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 877 aa  337  5.999999999999999e-91  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  28.31 
 
 		 882 aa  287  8e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  27.45 
 
 		 885 aa  283  8.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  28.97 
 
 		 880 aa  282  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 		 911 aa  280  6e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 		 881 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1165  valyl-tRNA synthetase  29.56 
 
 		 877 aa  272  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6497  valyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 		 903 aa  270  7e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3872  valyl-tRNA synthetase  29.08 
 
 		 872 aa  269  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  27.58 
 
 		 1002 aa  268  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  27.25 
 
 		 1006 aa  268  4e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0705  valyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 		 909 aa  268  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.727948  normal  0.597989 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5430  valyl-tRNA synthetase  28.71 
 
 		 905 aa  267  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0396856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 		 882 aa  268  5e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12260  valyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 		 882 aa  267  5.999999999999999e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7290  valyl-tRNA synthetase  29.28 
 
 		 882 aa  267  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0570872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3951  valyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 		 897 aa  267  8e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0678  valyl-tRNA synthetase  26.81 
 
 		 909 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  28.33 
 
 		 893 aa  266  1e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  26.77 
 
 		 909 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  30.47 
 
 		 881 aa  266  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 		 909 aa  266  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5880  valyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 		 903 aa  265  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  27.07 
 
 		 880 aa  264  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2630  valyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 900 aa  264  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  27.09 
 
 		 880 aa  264  6e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3947  valyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 955 aa  263  8e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3493  valyl-tRNA synthetase  28.76 
 
 		 872 aa  263  8.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7287  valyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 861 aa  263  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.429256 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  27.74 
 
 		 881 aa  263  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  27.74 
 
 		 881 aa  262  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  27.74 
 
 		 881 aa  262  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  27.74 
 
 		 881 aa  262  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 		 881 aa  262  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  26.35 
 
 		 879 aa  262  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2846  valyl-tRNA synthetase  27.52 
 
 		 904 aa  262  3e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.292827  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  27.52 
 
 		 881 aa  261  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0741  valyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 		 888 aa  261  5.0000000000000005e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0469934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1723  valyl-tRNA synthetase  27.68 
 
 		 912 aa  261  5.0000000000000005e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.419395  hitchhiker  0.00814152 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  27.61 
 
 		 881 aa  260  6e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  27.61 
 
 		 881 aa  260  7e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1281  valyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 		 933 aa  260  7e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.202707  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21531  valyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 		 933 aa  260  7e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0606355  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  27.61 
 
 		 881 aa  260  8e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>