More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2546 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2546  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  219  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.164416 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23790  nitrogen regulatory protein P-II  89.29 
 
 		 112 aa  197  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.269755 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1466  nitrogen regulatory protein P-II  83.78 
 
 		 113 aa  184  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0981  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1163  nitrogen regulatory protein P-II  82.88 
 
 		 113 aa  172  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334919  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1786  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  169  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1235  Nitrogen regulatory protein PII  68.75 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  163  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1394  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00884752  decreased coverage  0.00366325 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0969  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  158  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  68.75 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  156  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4014  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00726508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3148  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000232085  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1188  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671677  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3426  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  146  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000243696  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2479  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  147  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494885  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2491  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0578365  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1299  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 117 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2231  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  143  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000261063 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3268  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  143  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0681608  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0850  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 113 aa  142  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  140  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.04 
 
 		 112 aa  140  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  140  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  56.25 
 
 		 112 aa  140  8e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1609  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  140  8e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0701644  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  140  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 114 aa  139  9e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  57.14 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  55.36 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  54.46 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0156  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  55.36 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  55.36 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0421  nitrogen regulatory protein P-II  65.77 
 
 		 113 aa  138  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.666216 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  137  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  137  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  57.41 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  57.41 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3047  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.414736  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 114 aa  137  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  137  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 136 aa  137  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  54.46 
 
 		 112 aa  137  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  137  7e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  136  7.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  136  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  136  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  136  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 136 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  55.36 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>