37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2521 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2521  Bifunctional DNA primase/polymerase  100 
 
 		 206 aa  410  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0275963  normal  0.180999 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  41.76 
 
 		 289 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  39.86 
 
 		 263 aa  95.9  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  39.86 
 
 		 717 aa  95.9  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  39.86 
 
 		 263 aa  95.9  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  44.03 
 
 		 283 aa  94.4  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.54 
 
 		 287 aa  91.7  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  43.4 
 
 		 283 aa  90.9  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  38.46 
 
 		 717 aa  90.1  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  38.89 
 
 		 717 aa  89  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  33.54 
 
 		 746 aa  85.5  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  37.76 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  37.78 
 
 		 289 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  36.05 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  38.36 
 
 		 599 aa  76.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  40.37 
 
 		 749 aa  68.9  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1201  hypothetical protein  36.71 
 
 		 295 aa  65.1  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142595  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1451  bifunctional DNA primase/polymerase  28.57 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0151027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4212  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.9 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567212  normal  0.394336 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  37.75 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  42.42 
 
 		 746 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  42.42 
 
 		 746 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  36.31 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6679  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.7 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  35.66 
 
 		 955 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1983  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.7 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2304  hypothetical protein  39.25 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0886627  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3090  bifunctional DNA primase/polymerase  40.59 
 
 		 402 aa  49.7  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2837  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  39.47 
 
 		 183 aa  48.1  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0750475  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.45 
 
 		 970 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00280  hypothetical protein  38.06 
 
 		 314 aa  46.2  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.45 
 
 		 970 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3733  Bifunctional DNA primase/polymerase  43.18 
 
 		 271 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0829  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.59 
 
 		 305 aa  45.1  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  34.21 
 
 		 667 aa  45.1  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3067  PTS system, glucose-like IIB subunint  28.72 
 
 		 531 aa  42.4  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0062  hypothetical protein  32.46 
 
 		 391 aa  42  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>