More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2502 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2502  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  100 
 
 		 383 aa  769    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293735  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1489  radical SAM enzyme, Cfr family  77.93 
 
 		 375 aa  579  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23560  radical SAM enzyme, Cfr family  77.5 
 
 		 364 aa  569  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1009  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  73.76 
 
 		 376 aa  555  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.834278 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1420  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  68.24 
 
 		 391 aa  520  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0340942  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11240  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  64.86 
 
 		 426 aa  515  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.43214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1869  radical SAM protein  67.89 
 
 		 374 aa  505  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  67.38 
 
 		 395 aa  502  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0799869 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21300  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  65.87 
 
 		 465 aa  499  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.830404  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3237  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  69.04 
 
 		 376 aa  496  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1185  radical SAM enzyme, Cfr family  68.87 
 
 		 389 aa  494  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3404  radical SAM enzyme, Cfr family  68.1 
 
 		 388 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00306025  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1000  radical SAM enzyme, Cfr family  69 
 
 		 388 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.189733  normal  0.570497 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10170  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  64.46 
 
 		 429 aa  475  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0683  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  67.13 
 
 		 365 aa  475  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.882739  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5902  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  66.3 
 
 		 368 aa  466  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3677  radical SAM enzyme, Cfr family  65.01 
 
 		 365 aa  464  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1678  radical SAM enzyme, Cfr family  64.74 
 
 		 371 aa  461  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09960  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  65.94 
 
 		 370 aa  462  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.434962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2114  radical SAM enzyme, Cfr family  64.46 
 
 		 368 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2178  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  65.75 
 
 		 372 aa  443  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0846545  hitchhiker  0.000495188 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0409  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.96 
 
 		 389 aa  439  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.112692  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4121  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  62.98 
 
 		 365 aa  431  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3980  radical SAM enzyme, Cfr family  66.85 
 
 		 395 aa  432  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2203  radical SAM enzyme, Cfr family  63.49 
 
 		 388 aa  434  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00426672  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1327  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  64.02 
 
 		 353 aa  427  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2223  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  62.71 
 
 		 365 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522742  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1235  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  63.09 
 
 		 380 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478405  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  61.62 
 
 		 430 aa  421  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2006  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  63.49 
 
 		 374 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578114  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1987  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  63.49 
 
 		 374 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0876088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2052  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  63.49 
 
 		 374 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3577  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  61.64 
 
 		 421 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12894  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  60.82 
 
 		 364 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.942196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1166  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  64.27 
 
 		 385 aa  391  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.800858  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0286  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.86 
 
 		 361 aa  288  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4305  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.39 
 
 		 363 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  46.46 
 
 		 354 aa  266  5.999999999999999e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  44.04 
 
 		 371 aa  264  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0164  radical SAM enzyme, Cfr family  48.78 
 
 		 353 aa  264  2e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1376  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.41 
 
 		 399 aa  258  8e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5022  radical SAM protein  46.57 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3583  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.16 
 
 		 399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2956  radical SAM enzyme, Cfr family  41.95 
 
 		 342 aa  250  3e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2783  radical SAM enzyme, Cfr family  44.57 
 
 		 408 aa  249  4e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  41.34 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2310  hypothetical protein  44.84 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  39.94 
 
 		 348 aa  243  5e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1725  radical SAM protein  43.49 
 
 		 379 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2232  radical SAM protein  44.32 
 
 		 378 aa  242  9e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.750735  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6265  hypothetical protein  43.21 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1838  radical SAM protein  43.21 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.662917 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1814  radical SAM protein  43.21 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1347  radical SAM protein  43.84 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2357  radical SAM protein  43.84 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1109  radical SAM protein  43.84 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2230  radical SAM protein  43.84 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1752  radical SAM protein  43.21 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2192  radical SAM protein  43.84 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1837  radical SAM protein  43.84 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.323888  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0060  radical SAM protein  43.84 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0447485  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1461  radical SAM protein  43.49 
 
 		 378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0453987  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5115  hypothetical protein  43.21 
 
 		 379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1167  radical SAM protein  46.02 
 
 		 374 aa  240  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2543  radical SAM enzyme, Cfr family  42.51 
 
 		 383 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180565  hitchhiker  0.00648935 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1087  radical SAM enzyme, Cfr family  46.02 
 
 		 383 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486861  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0633  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.28 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  41.19 
 
 		 342 aa  236  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1422  radical SAM protein  41.96 
 
 		 382 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12366  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1592  hypothetical protein  42.23 
 
 		 383 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  39.88 
 
 		 349 aa  236  6e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  40.11 
 
 		 351 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1421  radical SAM protein  44.84 
 
 		 373 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  43.34 
 
 		 377 aa  234  3e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1338  radical SAM enzyme, Cfr family  38.68 
 
 		 351 aa  234  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0802459  normal  0.737261 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.67 
 
 		 349 aa  233  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  41.55 
 
 		 376 aa  233  6e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2488  radical SAM protein  37.78 
 
 		 356 aa  232  9e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00360289  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2191  radical SAM enzyme, Cfr family  42.06 
 
 		 392 aa  231  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.88 
 
 		 388 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2184  radical SAM enzyme, Cfr family  44.74 
 
 		 382 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1999  hypothetical protein  44.94 
 
 		 394 aa  232  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.175204 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02409  predicted enzyme  41.13 
 
 		 384 aa  230  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1151  radical SAM enzyme, Cfr family  41.13 
 
 		 384 aa  230  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.390398  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2892  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.13 
 
 		 384 aa  230  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02371  hypothetical protein  41.13 
 
 		 384 aa  230  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41 
 
 		 372 aa  230  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000522962  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2668  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.13 
 
 		 384 aa  230  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1160  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.13 
 
 		 384 aa  230  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0206768 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2801  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.13 
 
 		 384 aa  230  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2669  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.13 
 
 		 384 aa  230  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253648 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1183  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.79 
 
 		 398 aa  229  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1290  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.79 
 
 		 398 aa  229  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2677  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.06 
 
 		 388 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0421  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.43 
 
 		 398 aa  229  6e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.662236  hitchhiker  0.00298691 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2764  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.39 
 
 		 388 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2895  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.39 
 
 		 388 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2783  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.39 
 
 		 388 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.355164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2720  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.39 
 
 		 388 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.564025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1869  radical SAM protein  43.75 
 
 		 382 aa  229  7e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>