More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2436 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  74.06 
 
 
515 aa  639  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  100 
 
 
493 aa  958  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  74.95 
 
 
515 aa  657  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  76.18 
 
 
505 aa  668  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  73.22 
 
 
509 aa  682  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  75.31 
 
 
521 aa  656  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  70.48 
 
 
502 aa  625  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  73.01 
 
 
517 aa  623  1e-177  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  68.11 
 
 
553 aa  612  1e-174  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15477e-09 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  74.16 
 
 
501 aa  608  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  69.74 
 
 
522 aa  607  1e-172  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  73.09 
 
 
494 aa  602  1e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  70 
 
 
546 aa  586  1e-166  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  74.01 
 
 
530 aa  582  1e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  72.42 
 
 
485 aa  583  1e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  71.52 
 
 
512 aa  572  1e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  66.38 
 
 
503 aa  572  1e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  64.97 
 
 
493 aa  572  1e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  68.12 
 
 
482 aa  570  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  64.59 
 
 
493 aa  552  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  66.24 
 
 
512 aa  553  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  65.63 
 
 
486 aa  546  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  65.32 
 
 
487 aa  541  1e-152  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  63.64 
 
 
484 aa  531  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  65.92 
 
 
479 aa  532  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  64.21 
 
 
501 aa  524  1e-147  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1482  small GTP-binding protein  66.02 
 
 
524 aa  524  1e-147  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.578947  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1407  small GTP-binding protein  65.65 
 
 
515 aa  518  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  1.55427e-05 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1449  GTP-binding protein, HSR1-related  65.86 
 
 
494 aa  519  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.062201  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  62.75 
 
 
512 aa  519  1e-146  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1436  GTP-binding proten HflX  66.59 
 
 
480 aa  508  1e-142  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2164  GTP-binding protein, HSR1-related  64.38 
 
 
483 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.951338  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2210  GTP-binding protein, HSR1-related  64.38 
 
 
483 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.0439435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4564  GTP-binding proten HflX  66.74 
 
 
466 aa  504  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.631716  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2151  GTP-binding protein, HSR1-related  64.6 
 
 
483 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.0136453 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2436  GTP-binding protein, HSR1-related  64.6 
 
 
482 aa  495  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445847  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3960  GTP-binding protein, HSR1-related  64.24 
 
 
482 aa  493  1e-138  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.342247  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12738  GTP-binding protein hflX  64 
 
 
495 aa  486  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.324868 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  48.79 
 
 
421 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  48.4 
 
 
436 aa  340  4e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  2.11402e-05  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  45.84 
 
 
414 aa  338  1e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0528  GTP-binding proten HflX  62.68 
 
 
384 aa  334  2e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270654  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  47 
 
 
433 aa  334  3e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  2.74038e-09 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  46.32 
 
 
441 aa  332  9e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  45.2 
 
 
395 aa  325  1e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  50.74 
 
 
422 aa  323  5e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  6.12987e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  50.49 
 
 
425 aa  319  7e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  44.76 
 
 
444 aa  317  4e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  42.48 
 
 
437 aa  316  5e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  44.04 
 
 
582 aa  315  1e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  48.43 
 
 
421 aa  308  2e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  2.64606e-10 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  42 
 
 
413 aa  306  5e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  40.19 
 
 
419 aa  305  9e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  46.12 
 
 
442 aa  305  1e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  43.24 
 
 
415 aa  303  4e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  43.23 
 
 
435 aa  303  4e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  43.43 
 
 
596 aa  303  6e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  38.88 
 
 
419 aa  302  8e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  45.45 
 
 
454 aa  302  9e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  39.09 
 
 
419 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  47.37 
 
 
417 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  44.26 
 
 
454 aa  300  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  38.85 
 
 
419 aa  301  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  42.17 
 
 
420 aa  300  4e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  1.87355e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  38.85 
 
 
419 aa  300  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  38.85 
 
 
419 aa  300  4e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  39.37 
 
 
419 aa  300  5e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  38.61 
 
 
419 aa  300  5e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26379e-12 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  43.7 
 
 
461 aa  298  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  3.56343e-05  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  45.17 
 
 
440 aa  298  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  38.85 
 
 
419 aa  297  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  38.85 
 
 
419 aa  297  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  44.03 
 
 
414 aa  295  1e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  52.68 
 
 
561 aa  294  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  44.03 
 
 
414 aa  295  2e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  42.33 
 
 
429 aa  295  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1081  GTP-binding proten HflX  42.24 
 
 
405 aa  294  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0783851  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  47.56 
 
 
564 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  47.56 
 
 
564 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  45.29 
 
 
489 aa  293  3e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  45.29 
 
 
489 aa  294  3e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  45.48 
 
 
429 aa  293  4e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  47.92 
 
 
553 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  40.31 
 
 
401 aa  293  7e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  43.7 
 
 
429 aa  293  7e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  47.31 
 
 
428 aa  292  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  47.31 
 
 
428 aa  292  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  44.5 
 
 
441 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  45.38 
 
 
430 aa  291  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3652  putative GTPase HflX  47.31 
 
 
428 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  48.24 
 
 
450 aa  291  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  42.12 
 
 
401 aa  290  3e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  42.96 
 
 
439 aa  290  5e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  44.71 
 
 
439 aa  289  7e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  42.89 
 
 
433 aa  289  8e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  43.65 
 
 
433 aa  289  9e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  44.01 
 
 
433 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  41.85 
 
 
434 aa  288  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  43.46 
 
 
481 aa  288  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  42.54 
 
 
434 aa  287  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>