133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2428 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  66.4 
 
 		 750 aa  711    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  51.48 
 
 		 742 aa  652    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  57.09 
 
 		 757 aa  688    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  51.55 
 
 		 742 aa  660    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  100 
 
 		 726 aa  1403    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  58.19 
 
 		 741 aa  745    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  51.66 
 
 		 732 aa  648    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  53.83 
 
 		 759 aa  624  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  46.42 
 
 		 758 aa  618  1e-175  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  52.01 
 
 		 766 aa  618  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  47.33 
 
 		 759 aa  608  9.999999999999999e-173  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  51.94 
 
 		 758 aa  586  1e-166  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  48.39 
 
 		 747 aa  566  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  50.07 
 
 		 748 aa  559  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  48.35 
 
 		 754 aa  519  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  49.73 
 
 		 776 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  46.53 
 
 		 746 aa  513  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  48.52 
 
 		 786 aa  509  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  46.54 
 
 		 832 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  45.63 
 
 		 788 aa  507  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  45.71 
 
 		 795 aa  498  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  45.97 
 
 		 813 aa  494  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  46.04 
 
 		 804 aa  487  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  45.77 
 
 		 771 aa  481  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  43.71 
 
 		 829 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  45.3 
 
 		 765 aa  466  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  46.27 
 
 		 767 aa  465  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  42.14 
 
 		 902 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  44.5 
 
 		 874 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  41.1 
 
 		 735 aa  431  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  41.64 
 
 		 733 aa  427  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  42.27 
 
 		 724 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  42.27 
 
 		 724 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  40.21 
 
 		 734 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  42.13 
 
 		 724 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  43.28 
 
 		 685 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.96 
 
 		 691 aa  344  4e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  37.79 
 
 		 742 aa  335  2e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.81 
 
 		 715 aa  324  4e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.06 
 
 		 693 aa  321  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  36.61 
 
 		 715 aa  314  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.76 
 
 		 764 aa  312  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.02 
 
 		 732 aa  310  8e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  35.49 
 
 		 799 aa  309  9e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  36.79 
 
 		 726 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  38.06 
 
 		 716 aa  308  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  37.15 
 
 		 717 aa  304  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  39.41 
 
 		 710 aa  293  9e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  38.5 
 
 		 706 aa  288  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.4 
 
 		 705 aa  285  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  37.75 
 
 		 705 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  35.49 
 
 		 761 aa  273  9e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3495  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.81 
 
 		 728 aa  267  4e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.471615  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  39.41 
 
 		 706 aa  241  5e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  35.18 
 
 		 717 aa  230  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.2 
 
 		 755 aa  228  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  41.06 
 
 		 724 aa  225  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  44.57 
 
 		 703 aa  223  7e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  32.06 
 
 		 692 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  33.1 
 
 		 727 aa  220  6e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  40.88 
 
 		 659 aa  218  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  39.59 
 
 		 666 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  32.67 
 
 		 680 aa  200  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  40.56 
 
 		 670 aa  198  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  34.99 
 
 		 719 aa  197  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  38.16 
 
 		 695 aa  196  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.83 
 
 		 672 aa  195  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.47 
 
 		 695 aa  191  5e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  35.04 
 
 		 792 aa  180  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.28 
 
 		 645 aa  179  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  37.99 
 
 		 679 aa  178  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.32 
 
 		 710 aa  162  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  28.39 
 
 		 1048 aa  158  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  37.32 
 
 		 689 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  36.84 
 
 		 689 aa  142  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  36.84 
 
 		 689 aa  142  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  36.84 
 
 		 689 aa  142  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  36.36 
 
 		 691 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  36.36 
 
 		 691 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  36.36 
 
 		 689 aa  140  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  36.36 
 
 		 689 aa  140  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.15 
 
 		 861 aa  139  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  36.36 
 
 		 689 aa  139  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  36.36 
 
 		 691 aa  139  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  33.76 
 
 		 706 aa  134  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  32.91 
 
 		 706 aa  134  9e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.64 
 
 		 763 aa  127  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  34.63 
 
 		 755 aa  127  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.64 
 
 		 763 aa  127  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1625  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  33.05 
 
 		 768 aa  127  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  35.37 
 
 		 787 aa  124  7e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  33.97 
 
 		 760 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  33.49 
 
 		 702 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  40.87 
 
 		 712 aa  121  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  32.29 
 
 		 753 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  28.91 
 
 		 776 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  28.91 
 
 		 777 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  32.48 
 
 		 780 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  28.91 
 
 		 777 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1075  helicase, UvrD/Rep family  28.91 
 
 		 777 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>