More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2394 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1091  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  53.14 
 
 		 788 aa  727    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.305899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5233  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.75 
 
 		 704 aa  701    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157625 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1626  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  57.72 
 
 		 706 aa  691    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.135098  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5584  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  59.49 
 
 		 718 aa  717    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128967  normal  0.346665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3226  ATP-dependent DNA helicase RecQ family  56.71 
 
 		 691 aa  671    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225844  hitchhiker  0.0000186089 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5040  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.89 
 
 		 691 aa  723    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0447  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.99 
 
 		 708 aa  657    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0452326  decreased coverage  0.00000647403 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06850  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.33 
 
 		 713 aa  681    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0677  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.86 
 
 		 754 aa  667    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00766403  normal  0.0478204 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  64.86 
 
 		 766 aa  860    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.572742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.44 
 
 		 689 aa  707    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5950  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.59 
 
 		 749 aa  658    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0569292 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4657  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.03 
 
 		 691 aa  725    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0819  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  52.97 
 
 		 745 aa  653    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2394  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  100 
 
 		 756 aa  1464    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396069  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.66 
 
 		 734 aa  677    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22560  ATP-dependent DNA helicase RecQ  65.13 
 
 		 979 aa  884    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0184  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  55.67 
 
 		 741 aa  646    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1524  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.3 
 
 		 712 aa  692    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0672  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.18 
 
 		 729 aa  668    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20415  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0376  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.11 
 
 		 712 aa  651    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  60.57 
 
 		 724 aa  768    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1612  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  64.09 
 
 		 733 aa  838    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.644858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  57.74 
 
 		 691 aa  691    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346189  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0133  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.62 
 
 		 714 aa  741    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.931384  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3301  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  57.07 
 
 		 723 aa  717    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4745  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.03 
 
 		 691 aa  725    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.865957 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18920  ATP-dependent DNA helicase RecQ  51.02 
 
 		 762 aa  633  1e-180  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275245  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.14 
 
 		 708 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1940  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.73 
 
 		 706 aa  514  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187923  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1571  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.16 
 
 		 693 aa  501  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.000060483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1318  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.42 
 
 		 756 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0376564  decreased coverage  0.0000000122508 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0827  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.03 
 
 		 706 aa  493  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.493882  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1532  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.97 
 
 		 697 aa  482  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4035  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.68 
 
 		 679 aa  482  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000527005  normal  0.0486665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0315  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  45.44 
 
 		 698 aa  473  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0559  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.95 
 
 		 698 aa  464  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000154535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0673  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.74 
 
 		 695 aa  464  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.293047  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3718  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.9 
 
 		 698 aa  458  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3804  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.3 
 
 		 698 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00343497  decreased coverage  0.0000140841 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.54 
 
 		 693 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000979868  decreased coverage  0.000575313 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4347  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.37 
 
 		 699 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0558193  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1436  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40 
 
 		 691 aa  436  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000631982  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0485  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.97 
 
 		 697 aa  433  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1126  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.15 
 
 		 691 aa  412  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.760992  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.91 
 
 		 448 aa  254  5.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264596  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.19 
 
 		 543 aa  210  9e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.19 
 
 		 543 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.19 
 
 		 543 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6295  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.69 
 
 		 590 aa  209  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.33 
 
 		 626 aa  207  8e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.89 
 
 		 602 aa  205  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.11 
 
 		 615 aa  204  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.08 
 
 		 1376 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.45 
 
 		 630 aa  203  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.74 
 
 		 625 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3025  ATP-dependent DNA helicase protein  41.03 
 
 		 637 aa  202  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0062287  normal  0.0101494 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.73 
 
 		 588 aa  202  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2064  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.02 
 
 		 729 aa  201  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256854  normal  0.150426 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3305  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.71 
 
 		 637 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.563115  normal  0.0132339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0829  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.77 
 
 		 546 aa  199  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.14 
 
 		 593 aa  199  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.14 
 
 		 593 aa  199  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2958  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.71 
 
 		 636 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217223 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0020  hypothetical protein  35.71 
 
 		 493 aa  198  3e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.14 
 
 		 592 aa  198  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1542  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.65 
 
 		 592 aa  198  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.67 
 
 		 545 aa  197  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3200  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.79 
 
 		 600 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47969  ATP-dependent DNA helicase  32.05 
 
 		 1148 aa  196  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.13 
 
 		 596 aa  195  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0308  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.13 
 
 		 615 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.356078  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2335  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.31 
 
 		 593 aa  195  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.699983  normal  0.515906 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.52 
 
 		 607 aa  195  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.78 
 
 		 724 aa  195  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0321  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.94 
 
 		 615 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0467683 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4701  ATP-dependent DNA helicase, RecQ  39.47 
 
 		 618 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2765  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.94 
 
 		 615 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0342  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.94 
 
 		 615 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1359  DEAD/DEAH box helicase  41.45 
 
 		 681 aa  194  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6077  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.44 
 
 		 618 aa  194  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.9148  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.42 
 
 		 615 aa  194  6e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0027  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.45 
 
 		 681 aa  194  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0879817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.72 
 
 		 725 aa  194  7e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2659  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.69 
 
 		 679 aa  193  9e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.18 
 
 		 605 aa  193  9e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.514441  normal  0.157684 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.92 
 
 		 721 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.94 
 
 		 615 aa  193  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0270  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.94 
 
 		 615 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.816269 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0884  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.06 
 
 		 595 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.385904  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.16 
 
 		 607 aa  192  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2961  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.69 
 
 		 622 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1249  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.87 
 
 		 557 aa  192  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3441  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.75 
 
 		 615 aa  192  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000567848  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.13 
 
 		 644 aa  192  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0876032  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.08 
 
 		 731 aa  192  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.15 
 
 		 646 aa  192  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3472  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.13 
 
 		 615 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.290967  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3783  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.13 
 
 		 647 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0410934  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1918  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.13 
 
 		 658 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0352657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>