More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2327 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
192 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  47.4 
 
 
198 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  42.94 
 
 
211 aa  118  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  45.08 
 
 
192 aa  112  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
195 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  41.04 
 
 
205 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  40.1 
 
 
215 aa  104  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  40.1 
 
 
215 aa  104  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  40.1 
 
 
215 aa  104  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  36.9 
 
 
201 aa  102  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  39.88 
 
 
196 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
197 aa  98.6  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 
195 aa  97.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
195 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  37.99 
 
 
225 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  39.31 
 
 
196 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 
201 aa  95.5  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 
196 aa  95.1  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  36.48 
 
 
211 aa  94  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 
209 aa  92  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
205 aa  91.3  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 
222 aa  91.3  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
201 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 
197 aa  85.5  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  32.08 
 
 
197 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  38.35 
 
 
192 aa  85.1  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
197 aa  84.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 
211 aa  84.7  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  39.68 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
198 aa  82  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  37.98 
 
 
234 aa  81.6  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0972  transcriptional regulator, TetR family  40.72 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0921311  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  41.32 
 
 
233 aa  78.6  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
198 aa  78.2  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  32 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  34.72 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
205 aa  71.2  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
202 aa  71.2  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  45.24 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6079  transcriptional regulator, TetR family  36.29 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.615867 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  46.25 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  43.96 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.796627 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  34.55 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.55 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.55 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.55 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.55 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.55 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.55 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  36.64 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  34.55 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 
87 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
190 aa  63.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 
199 aa  63.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
233 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 
186 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
238 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
190 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0636  TetR family transcriptional regulator  52.31 
 
 
250 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0304513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.64 
 
 
217 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.64 
 
 
217 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.64 
 
 
217 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.64 
 
 
217 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.64 
 
 
217 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 
211 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
202 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
212 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 
190 aa  61.6  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
212 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
212 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
207 aa  61.6  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 
203 aa  61.6  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
190 aa  61.2  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
210 aa  61.2  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
261 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.73 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 
198 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3383  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
197 aa  59.3  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
234 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
234 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>