41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2285 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2285  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
329 aa  631  1e-180  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30370  streptomycin 6-kinase  33.67 
 
 
326 aa  119  7.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1604  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  33.45 
 
 
310 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0859815  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2188  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  32.49 
 
 
300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2219  6-kinase  34.25 
 
 
307 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000195606  decreased coverage  0.000000830578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2714  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  34.17 
 
 
298 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4253  6-kinase  29.53 
 
 
309 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3440  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  32.25 
 
 
310 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.0646314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5378  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  33.69 
 
 
307 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0942193  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0261  6-kinase  32.73 
 
 
312 aa  93.2  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1892  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  32.99 
 
 
303 aa  92.8  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.565098  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1422  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  32.89 
 
 
373 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000015998 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1410  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  30.65 
 
 
331 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.189739  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0514  aminoglycoside phosphotransferase family protein  26.95 
 
 
323 aa  87.8  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24730  streptomycin 6-kinase  32.29 
 
 
312 aa  85.9  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.320785  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1665  hydroxyurea phosphotransferase  26.6 
 
 
468 aa  83.2  0.000000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0803  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  33.92 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4087  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  32.65 
 
 
311 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4430  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  31.47 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.796967  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2429  streptomycin 6-kinase  28.25 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4780  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  34.17 
 
 
288 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.35446  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3746  kinase  30.94 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5323  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  30.93 
 
 
286 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0213  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  31 
 
 
264 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53187  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35670  streptomycin 6-kinase  28.52 
 
 
293 aa  59.7  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1923  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  29.41 
 
 
270 aa  57.4  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.970789  normal  0.364097 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0298  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  27.82 
 
 
309 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.449073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40450  streptomycin 3''-phosphotransferase  30 
 
 
273 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4830  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  39.25 
 
 
279 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.975456 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5439  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  39.25 
 
 
279 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5423  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  39.25 
 
 
279 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2660  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  31.36 
 
 
302 aa  53.1  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.31665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3035  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  27.34 
 
 
264 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3331  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  30.55 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0145653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5400  methionyl aminopeptidase  47.54 
 
 
592 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2457  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  32.69 
 
 
271 aa  50.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3432  streptomycin 3''-kinase  28.19 
 
 
273 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7130  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  27.97 
 
 
267 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2227  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  28.78 
 
 
284 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000351208 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6740  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  32.46 
 
 
195 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.515354 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1673  streptomycin resistance protein  32.74 
 
 
288 aa  43.5  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>