23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2260 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2260  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 410 aa  816    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.445359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3558  endoglycoceramidase  41.35 
 
 		 490 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5206  glycoside hydrolase family protein  35.38 
 
 		 553 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253105  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5653  glycoside hydrolase family protein  35.38 
 
 		 553 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227096  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0664  glycoside hydrolase family 5  28.54 
 
 		 470 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1713  glycoside hydrolase family protein  33.5 
 
 		 472 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1364  glycoside hydrolase family 5  35.07 
 
 		 618 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00194405  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6164  glycoside hydrolase family 5  36.24 
 
 		 612 aa  77.4  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791591  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0370  glycoside hydrolase family 5  33.33 
 
 		 661 aa  76.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.674387  normal  0.0657356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5302  hypothetical protein  32.38 
 
 		 632 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00149118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0833  hypothetical protein  30.95 
 
 		 656 aa  70.9  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.982432  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03013  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08820)  25.4 
 
 		 763 aa  59.7  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02490  cytoplasm protein, putative  24.71 
 
 		 851 aa  53.9  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55209  predicted protein  25.22 
 
 		 912 aa  52  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06030  cytoplasm protein, putative  26.59 
 
 		 742 aa  50.1  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749015  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  23.21 
 
 		 847 aa  47.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6027  Beta-galactosidase  46.3 
 
 		 656 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330349  normal  0.994275 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6327  Beta-galactosidase  46.3 
 
 		 656 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  24.39 
 
 		 468 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  27.91 
 
 		 601 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  22.58 
 
 		 869 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0311  Beta-galactosidase  42.62 
 
 		 711 aa  43.1  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0181132  normal  0.0282735 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2516  Beta-galactosidase  40 
 
 		 670 aa  43.1  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>