More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2197 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_01730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  62.25 
 
 		 560 aa  665    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1965  extracellular solute-binding protein family 5  76.46 
 
 		 556 aa  834    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 556 aa  1122    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  53.32 
 
 		 610 aa  596  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0480  extracellular solute-binding protein family 5  54.25 
 
 		 569 aa  554  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105843  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0216  extracellular solute-binding protein  51.03 
 
 		 553 aa  533  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.923383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0255  extracellular solute-binding protein  50.78 
 
 		 554 aa  527  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192685  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0206  extracellular solute-binding protein family 5  46.96 
 
 		 561 aa  482  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.646254  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  46.54 
 
 		 566 aa  478  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3638  extracellular solute-binding protein family 5  47.62 
 
 		 555 aa  462  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339986  normal  0.415005 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19540  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  45.33 
 
 		 567 aa  460  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.394832  normal  0.058637 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0658  extracellular solute-binding protein family 5  43.97 
 
 		 577 aa  450  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2548  extracellular solute-binding protein  41.85 
 
 		 584 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0070372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6149  extracellular solute-binding protein family 5  41.18 
 
 		 566 aa  411  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.784749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2285  extracellular solute-binding protein family 5  42.61 
 
 		 535 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000852999 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  36.57 
 
 		 524 aa  317  5e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  33.94 
 
 		 534 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  33.58 
 
 		 535 aa  294  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  37.17 
 
 		 565 aa  286  7e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  32.45 
 
 		 525 aa  273  5.000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  32.05 
 
 		 541 aa  272  9e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  33.65 
 
 		 529 aa  268  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  34.43 
 
 		 595 aa  268  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  32.5 
 
 		 528 aa  264  3e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  33.02 
 
 		 532 aa  256  9e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  33.02 
 
 		 532 aa  256  9e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  32.14 
 
 		 531 aa  250  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  31.89 
 
 		 538 aa  250  5e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1582  extracellular solute-binding protein  32.4 
 
 		 531 aa  248  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  32.62 
 
 		 529 aa  242  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  30.89 
 
 		 542 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08450  Predicted extracellular solute-binding protein, family 5  32.12 
 
 		 554 aa  238  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.891256  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  31.67 
 
 		 547 aa  234  3e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 532 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 		 530 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  31.77 
 
 		 531 aa  229  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 		 532 aa  229  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 528 aa  227  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  29.72 
 
 		 535 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  29.72 
 
 		 535 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  29.72 
 
 		 535 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.72 
 
 		 535 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  29.72 
 
 		 535 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 530 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.72 
 
 		 535 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.72 
 
 		 535 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.55 
 
 		 535 aa  223  6e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0924  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 		 541 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0885  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.87 
 
 		 541 aa  223  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.575043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4559  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.41 
 
 		 530 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  30.26 
 
 		 526 aa  221  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0845  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 		 532 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.74 
 
 		 526 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.74 
 
 		 526 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.74 
 
 		 526 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.74 
 
 		 526 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0399  extracellular solute-binding protein family 5  29.64 
 
 		 546 aa  219  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2065  extracellular solute-binding protein family 5  31.91 
 
 		 543 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1526  extracellular solute-binding protein  31.65 
 
 		 544 aa  219  1e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0884  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.26 
 
 		 530 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0511525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.55 
 
 		 526 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  29.8 
 
 		 535 aa  218  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0923  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 		 530 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  31.47 
 
 		 544 aa  218  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  30.59 
 
 		 532 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1949  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 542 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0969647  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  31.62 
 
 		 528 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  28.81 
 
 		 535 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 		 545 aa  217  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  28.63 
 
 		 535 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0815  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 		 532 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0927  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 530 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0928  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 		 541 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  29.48 
 
 		 535 aa  215  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  29.48 
 
 		 535 aa  215  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  28.87 
 
 		 532 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.48 
 
 		 535 aa  215  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 		 541 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  29.16 
 
 		 535 aa  213  5.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4294  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 		 530 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.502669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  29.17 
 
 		 537 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  29.22 
 
 		 537 aa  213  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  32.53 
 
 		 533 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4558  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  29.15 
 
 		 540 aa  210  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.44901  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  32.47 
 
 		 531 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3963  hypothetical protein  32.7 
 
 		 508 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.81037  normal  0.136891 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 531 aa  207  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3283  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 		 545 aa  206  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4235  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 		 542 aa  206  9e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0844  extracellular solute-binding protein  32.13 
 
 		 531 aa  206  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  28.07 
 
 		 531 aa  206  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0390  extracellular solute-binding protein family 5  31 
 
 		 531 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18086  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  28.01 
 
 		 535 aa  205  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 		 506 aa  204  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0422  extracellular solute-binding protein family 5  31.21 
 
 		 531 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00166095  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  31.07 
 
 		 589 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  28.71 
 
 		 535 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  31.42 
 
 		 520 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  30.68 
 
 		 532 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  28.57 
 
 		 533 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>