More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2169 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2169  triosephosphate isomerase  100 
 
 
265 aa  534  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  74.14 
 
 
264 aa  403  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  73.46 
 
 
261 aa  394  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  71.04 
 
 
264 aa  386  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1258  triosephosphate isomerase  69.11 
 
 
260 aa  371  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352341  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2532  triosephosphate isomerase  68.6 
 
 
264 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  69.53 
 
 
265 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  67.97 
 
 
258 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  65.89 
 
 
260 aa  350  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2929  Triose-phosphate isomerase  65.5 
 
 
261 aa  340  2e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6036  triose-phosphate isomerase  62.74 
 
 
261 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  64.71 
 
 
261 aa  335  5e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2089  triosephosphate isomerase  63.04 
 
 
271 aa  331  6e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19012  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  60.92 
 
 
263 aa  328  7e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  62.07 
 
 
263 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1830  Triose-phosphate isomerase  59.92 
 
 
271 aa  325  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136952 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13130  triosephosphate isomerase  60.62 
 
 
263 aa  325  5e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.751982  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  62.2 
 
 
687 aa  324  7e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  62.55 
 
 
258 aa  315  3e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  59.07 
 
 
260 aa  316  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11370  triosephosphate isomerase  63.57 
 
 
263 aa  313  2.9999999999999996e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.413237  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2048  triosephosphate isomerase  58.3 
 
 
287 aa  311  6.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  58.33 
 
 
260 aa  306  3e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  58.33 
 
 
261 aa  305  7e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  58.43 
 
 
261 aa  304  9.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  58.57 
 
 
262 aa  301  7.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5606  triosephosphate isomerase  59.77 
 
 
263 aa  299  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245433  normal  0.85925 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  58.33 
 
 
261 aa  296  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  57.14 
 
 
261 aa  296  3e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  56.52 
 
 
270 aa  294  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2705  triosephosphate isomerase  58.73 
 
 
261 aa  292  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11466  triosephosphate isomerase  57.94 
 
 
261 aa  287  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000235283  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2406  triosephosphate isomerase  57.77 
 
 
261 aa  285  7e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2446  triosephosphate isomerase  57.77 
 
 
261 aa  285  7e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2452  triosephosphate isomerase  57.77 
 
 
261 aa  285  7e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.487817 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  57.31 
 
 
308 aa  280  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0433  triosephosphate isomerase  51.36 
 
 
267 aa  279  3e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.292554  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0907  triose-phosphate isomerase  52.14 
 
 
265 aa  275  7e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  49.23 
 
 
257 aa  239  4e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  50.59 
 
 
250 aa  238  6.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  44.66 
 
 
256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  46.85 
 
 
248 aa  232  5e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  45.85 
 
 
257 aa  229  3e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 
249 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  47.84 
 
 
251 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  46.83 
 
 
256 aa  226  3e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  46.03 
 
 
248 aa  223  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  48.03 
 
 
254 aa  223  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  50.78 
 
 
249 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  45.06 
 
 
255 aa  223  2e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  46.43 
 
 
250 aa  223  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  41.57 
 
 
251 aa  223  3e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 
255 aa  221  7e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  46.09 
 
 
251 aa  221  8e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  46.67 
 
 
250 aa  221  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  42.41 
 
 
275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  45.06 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  46.09 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  44.09 
 
 
248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  44.09 
 
 
248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  43.58 
 
 
252 aa  218  8.999999999999998e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.64 
 
 
654 aa  217  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  42.69 
 
 
254 aa  217  1e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  45.31 
 
 
251 aa  217  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  42.29 
 
 
251 aa  217  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  45.85 
 
 
250 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  46.67 
 
 
257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 
251 aa  216  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  43.7 
 
 
253 aa  215  5e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  45.28 
 
 
253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  43.97 
 
 
253 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  45.74 
 
 
251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  45.28 
 
 
254 aa  211  7.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  42.97 
 
 
252 aa  211  9e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  44.88 
 
 
254 aa  210  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  43.87 
 
 
250 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  43.92 
 
 
251 aa  209  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  43.36 
 
 
650 aa  209  5e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  43.48 
 
 
256 aa  208  6e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  42.02 
 
 
655 aa  208  7e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  44.14 
 
 
248 aa  208  7e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  44.66 
 
 
250 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  45.42 
 
 
243 aa  207  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  48.22 
 
 
253 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  42.75 
 
 
252 aa  207  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  44.53 
 
 
251 aa  206  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 
253 aa  206  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 
253 aa  206  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  44.14 
 
 
252 aa  205  5e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  44.17 
 
 
243 aa  205  6e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0851  triosephosphate isomerase  45.67 
 
 
275 aa  205  7e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  44.66 
 
 
249 aa  205  8e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  48.22 
 
 
253 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  40.08 
 
 
250 aa  204  1e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  44.14 
 
 
250 aa  204  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  42.13 
 
 
251 aa  203  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 
253 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 
251 aa  203  3e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  46.33 
 
 
251 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  46.33 
 
 
251 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>