281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2097 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2097  PfkB domain protein  100 
 
 
296 aa  556  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0568706  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0020  PfkB domain protein  34.62 
 
 
291 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0022  PfkB domain protein  34.62 
 
 
291 aa  182  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0378  PfkB domain protein  50.17 
 
 
301 aa  176  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1913  PfkB domain-containing protein  34.03 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1940  PfkB  35.34 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.0238447 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1546  PfkB domain protein  34.27 
 
 
285 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418317 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5021  PfkB domain protein  48.87 
 
 
311 aa  172  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38340  sugar kinase, ribokinase  42.31 
 
 
288 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1986  PfkB  35.66 
 
 
286 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.842187 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3555  PfkB domain protein  46.43 
 
 
284 aa  152  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1314  PfkB domain protein  45.48 
 
 
301 aa  146  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0587994  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1248  PfkB domain protein  37.87 
 
 
310 aa  143  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000612898  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6930  PfkB domain protein  40.45 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  35.46 
 
 
298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5931  hypothetical protein  44.5 
 
 
453 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.090162  decreased coverage  0.00187432 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  34.17 
 
 
314 aa  100  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0671  PfkB  33.08 
 
 
309 aa  99  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4268  PfkB family kinase  34.04 
 
 
298 aa  99  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  33.33 
 
 
298 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03768  predicted sugar kinase  33.69 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4103  PfkB domain protein  33.69 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4406  PfkB family kinase  33.69 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03717  hypothetical protein  33.69 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  33.69 
 
 
298 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  33.92 
 
 
324 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  33.33 
 
 
298 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  33.33 
 
 
298 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  33.33 
 
 
298 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  33.33 
 
 
298 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0799  ribokinase-like domain-containing protein  35.96 
 
 
310 aa  92.4  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0090  PfkB  33.58 
 
 
309 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1019  PfkB domain protein  36.53 
 
 
284 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.485278 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  32.63 
 
 
302 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  32.29 
 
 
304 aa  88.6  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2838  putative sugar kinase  27.37 
 
 
299 aa  82.4  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0616  PfkB domain protein  30.66 
 
 
312 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0460  PfkB  28.92 
 
 
308 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.413409  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5201  PfkB domain protein  31.51 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4029  carbohydrate kinase, PfkB  36.79 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  30.48 
 
 
304 aa  79  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3654  PfkB  27.63 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1805  PfkB  27.63 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  30.33 
 
 
297 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4302  PfkB domain protein  27.8 
 
 
297 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4851  PfkB  28.77 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  27 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  27 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  27 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  27 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0113  PfkB domain protein  30.34 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  27 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1648  PfkB  25.7 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46421  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  26.67 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  28.86 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  26.92 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  26.33 
 
 
298 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  27.24 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  26.33 
 
 
298 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  26.33 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  30.9 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  25.96 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  26.55 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  24.65 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  29.79 
 
 
298 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4140  ribokinase-like domain-containing protein  29.79 
 
 
298 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.682006  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2455  PfkB domain-containing protein  34.05 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.287722  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  29.18 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  29.97 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  31.27 
 
 
308 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  25.98 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  31.27 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  27.39 
 
 
424 aa  64.7  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  31.62 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  33.59 
 
 
296 aa  63.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0358  ribokinase-like domain-containing protein  31.71 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0279  PfkB domain protein  32.34 
 
 
320 aa  63.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0301345 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  26.21 
 
 
301 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  28.15 
 
 
295 aa  62.8  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  31.76 
 
 
295 aa  62.4  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  31.18 
 
 
315 aa  62.4  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  31.18 
 
 
315 aa  62.4  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0652  PfkB domain-containing protein  30.07 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  29.89 
 
 
313 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  27.99 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  29.76 
 
 
309 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  20.89 
 
 
304 aa  60.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  31.4 
 
 
315 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  26.15 
 
 
305 aa  60.1  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2334  PfkB domain protein  25.81 
 
 
314 aa  60.1  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0161012  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  29.76 
 
 
309 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  28.01 
 
 
295 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  25.44 
 
 
403 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  27.27 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  28.29 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7070  PfkB domain protein  51.32 
 
 
283 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  25.51 
 
 
398 aa  58.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  25.52 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5483  PfkB domain protein  30.07 
 
 
313 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  27.47 
 
 
308 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>