More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2070 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 151 aa  305  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  74.29 
 
 		 146 aa  216  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  74.29 
 
 		 146 aa  216  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  74.29 
 
 		 146 aa  216  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  76.09 
 
 		 147 aa  214  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  78.46 
 
 		 149 aa  212  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  74.82 
 
 		 139 aa  212  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  72.6 
 
 		 150 aa  212  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  71.53 
 
 		 143 aa  209  7.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0110  transcriptional regulator, AraC family  69.8 
 
 		 148 aa  209  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2229  helix-turn-helix domain-containing protein  74.81 
 
 		 160 aa  205  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  74.81 
 
 		 147 aa  203  6e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2902  transcriptional regulator, AraC family  78.12 
 
 		 148 aa  203  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000233249  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4177  AraC family transcriptional regulator  73.05 
 
 		 147 aa  202  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0005743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  69.23 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  74.47 
 
 		 147 aa  197  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2347  AraC family transcriptional regulator  76.47 
 
 		 153 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.745211  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3172  transcriptional regulator, AraC family  71.63 
 
 		 147 aa  189  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984429 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  71.97 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1692  transcriptional regulator, AraC family  72.79 
 
 		 144 aa  186  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  74.14 
 
 		 155 aa  178  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2345  AraC family transcriptional regulator  72.36 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  0.707211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  63.36 
 
 		 141 aa  170  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  63.36 
 
 		 145 aa  166  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7719  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  71.82 
 
 		 134 aa  153  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  58.91 
 
 		 144 aa  149  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3902  AraC family transcriptional regulator  57.36 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2622  AraC family transcriptional regulator  73.2 
 
 		 144 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0623  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  61.26 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.464134  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  48 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  48.39 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  45.97 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  43.09 
 
 		 164 aa  107  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  45.67 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  43.2 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  43.33 
 
 		 140 aa  103  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  46.85 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  46.43 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0841  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 176 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4299  transcriptional regulator, AraC family  41.46 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  40.74 
 
 		 156 aa  96.7  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  46.02 
 
 		 168 aa  96.3  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  44.53 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  39.68 
 
 		 168 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  39.68 
 
 		 168 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2081  transcriptional regulator, AraC family  40.94 
 
 		 153 aa  94  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.256  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1506  AraC family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 182 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 168 aa  89.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  41.9 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12670  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  37.93 
 
 		 250 aa  80.9  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 204 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0872  AraC family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 292 aa  80.5  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  37.86 
 
 		 513 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 286 aa  78.2  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 327 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  33.94 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0874  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  39.6 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  39.6 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 299 aa  75.1  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 265 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 291 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 291 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 301 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5692  transcriptional regulator, AraC family  35.58 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  40.43 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  34.34 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  40.59 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  37.86 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  38.54 
 
 		 301 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4704  putative DNA-binding protein  32.74 
 
 		 274 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000153171  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 306 aa  72  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  35.78 
 
 		 291 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 316 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 291 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  38.54 
 
 		 307 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 544 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  37.37 
 
 		 324 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 301 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5702  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 319 aa  70.5  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.946416 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 322 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 305 aa  70.1  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 		 293 aa  70.1  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  43.02 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 1201 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2693  helix-turn-helix domain-containing protein  36.04 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.129803  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5508  helix-turn-helix domain-containing protein  34.86 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>