208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2027 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
189 aa  382  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4631  deaminase-reductase domain-containing protein  76.32 
 
 
192 aa  291  5e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  77.37 
 
 
192 aa  290  8e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3142  deaminase-reductase domain-containing protein  74.74 
 
 
192 aa  284  5.999999999999999e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.921485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  57.67 
 
 
190 aa  213  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  54.5 
 
 
187 aa  195  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  53.44 
 
 
208 aa  187  5.999999999999999e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.08 
 
 
180 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.84 
 
 
187 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.24 
 
 
197 aa  99.8  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  34.54 
 
 
198 aa  98.6  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  39.26 
 
 
179 aa  98.6  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  36.36 
 
 
221 aa  95.1  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.5 
 
 
201 aa  93.6  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.87 
 
 
201 aa  94.4  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.26 
 
 
224 aa  94  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  38.6 
 
 
196 aa  91.7  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.26 
 
 
180 aa  91.7  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.38 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.84 
 
 
221 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.5 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  30.21 
 
 
181 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.5 
 
 
219 aa  90.1  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.29 
 
 
210 aa  89.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  34.55 
 
 
178 aa  89.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.34 
 
 
221 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  36.13 
 
 
221 aa  89  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 
221 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.53 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  29.17 
 
 
181 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.68 
 
 
204 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.5 
 
 
204 aa  85.1  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  31.1 
 
 
228 aa  84.7  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.84 
 
 
204 aa  84.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  34.34 
 
 
208 aa  84  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.29 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  30.41 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.5 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  34.88 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  35.58 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.24 
 
 
183 aa  82  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  33.85 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.03 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.46 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  35.64 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  31.38 
 
 
199 aa  78.2  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  31.98 
 
 
215 aa  77.8  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.84 
 
 
212 aa  77.8  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  30.1 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
183 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  26.98 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  32.83 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.78 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  35.05 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.5 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0067  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.12 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.482424  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2638  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.33 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  30.57 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2667  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.81 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  32.64 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  32.32 
 
 
213 aa  72  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  28.65 
 
 
183 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  32.16 
 
 
219 aa  72  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  32.45 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.16 
 
 
202 aa  71.2  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.84 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.42 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.5 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  29.23 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.24 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.41 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.55 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.92 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.93 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  27.32 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.74 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.5 
 
 
181 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.85 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.35 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  29.44 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21110  dihydrofolate reductase  32.72 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.540595  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.29 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  27.78 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0902  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.35 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.27 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.58 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3987  bifunctional deaminase-reductase-like  36 
 
 
177 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  31 
 
 
199 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.44 
 
 
189 aa  63.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0489  deaminase-reductase domain-containing protein  34.1 
 
 
176 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.684638  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.41 
 
 
177 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  29 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.05 
 
 
182 aa  62  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.17 
 
 
194 aa  62  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  29.5 
 
 
191 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.02 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.23 
 
 
188 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.73 
 
 
190 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>