223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1968 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1968  AFG1-family ATPase  100 
 
 		 354 aa  687    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  decreased coverage  0.0000116257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16620  predicted ATPase  62.43 
 
 		 372 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24763 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1883  AFG1-family ATPase  61.45 
 
 		 358 aa  364  1e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.927457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7388  AFG1-family ATPase  58.91 
 
 		 363 aa  361  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1740  AFG1-family ATPase  63 
 
 		 363 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.137438 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3078  AFG1-family ATPase  59.28 
 
 		 356 aa  354  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0545755 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1899  AFG1-family ATPase  53.89 
 
 		 343 aa  352  5e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13800  predicted ATPase  58.11 
 
 		 353 aa  351  1e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.908748  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1388  AFG1-family ATPase  56.4 
 
 		 352 aa  350  2e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.629214  normal  0.139105 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23980  predicted ATPase  56.97 
 
 		 349 aa  345  5e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669926  normal  0.124447 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3542  AFG1-family ATPase  57.19 
 
 		 333 aa  341  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000203163  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3912  AFG1 family ATPase  54.38 
 
 		 349 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0771393  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1581  AFG1-family ATPase  55.26 
 
 		 335 aa  334  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2491  AFG1 family ATPase  53.96 
 
 		 345 aa  333  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2272  AFG1-family ATPase  51.99 
 
 		 337 aa  330  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2220  AFG1-like ATPase  53.17 
 
 		 349 aa  322  5e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2266  AFG1 family ATPase  53.17 
 
 		 349 aa  322  5e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2209  AFG1 family ATPase  53.17 
 
 		 349 aa  322  5e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0757112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1660  AFG1-family ATPase  52.4 
 
 		 345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000156302 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12685  hypothetical protein  52.24 
 
 		 369 aa  317  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000506976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1667  AFG1 family ATPase  52.11 
 
 		 345 aa  315  6e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.368599  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1346  AFG1-like ATPase  51.09 
 
 		 390 aa  300  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10730  predicted ATPase  50.3 
 
 		 351 aa  298  1e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0149  AFG1-family ATPase  43.07 
 
 		 325 aa  229  7e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.842308  normal  0.156894 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2019  AFG1-like protein ATPase  42.6 
 
 		 350 aa  222  7e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.842851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  27.9 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  27.57 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  27.81 
 
 		 370 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  27.57 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  28.82 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  27.27 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  27.27 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  28.49 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  27.49 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  27.49 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  27.53 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  28.03 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  31.56 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  27.38 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1096  AFG1 family ATPase  28.47 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.352008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  23.8 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  31.56 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  25.92 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  26.32 
 
 		 364 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1792  AFG1 family ATPase  33.22 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  25.36 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  26.32 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  25.81 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  31.94 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  26.74 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  29.05 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  26.04 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  27.36 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  29.3 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  25.44 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  29.3 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  29.3 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  25.39 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3976  AFG1 family ATPase  29.86 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.605596  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  31.94 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  31.94 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  27.27 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  31.47 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  25.57 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5175  AFG1 family ATPase  35.58 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  25.87 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  25.87 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  31.94 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  31.94 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  25.36 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  31.94 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  31.94 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  31.94 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  30 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  30 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  30 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  25.07 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  31.94 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  30 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  30 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  30.22 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  30 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  29.55 
 
 		 375 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  30.89 
 
 		 365 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  30.89 
 
 		 365 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  25.6 
 
 		 367 aa  67  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  30 
 
 		 375 aa  67  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  31.25 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  26.15 
 
 		 364 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  30.89 
 
 		 365 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  27.71 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  27.32 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  25.79 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  24.64 
 
 		 368 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  26.07 
 
 		 365 aa  65.9  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1767  AFG1 family ATPase  29.61 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2909  hypothetical protein  26.59 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332775  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  26.53 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  31.91 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  30.73 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>