58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1898 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1898  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 407 aa  774    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107111  decreased coverage  0.00000153427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13130  predicted amino acid aldolase or racemase  60.2 
 
 		 403 aa  410  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709051  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0956  alanine racemase domain-containing protein  57 
 
 		 391 aa  393  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5489  alanine racemase domain protein  56.58 
 
 		 407 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.525884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0845  alanine racemase domain-containing protein  56.35 
 
 		 403 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4702  alanine racemase domain protein  55.43 
 
 		 444 aa  383  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1282  alanine racemase domain protein  53.94 
 
 		 419 aa  378  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0410  alanine racemase domain protein  57 
 
 		 415 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2357  hypothetical protein  55.06 
 
 		 401 aa  373  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0031  alanine racemase domain protein  59.75 
 
 		 395 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4405  hypothetical protein  60.86 
 
 		 402 aa  371  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.443829  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00520  predicted amino acid aldolase or racemase  61.01 
 
 		 393 aa  371  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3855  alanine racemase domain protein  56.42 
 
 		 397 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.842068  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4024  hypothetical protein  60.35 
 
 		 427 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1751  amino acid aldolase or racemase-like protein  56.82 
 
 		 397 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1520  alanine racemase domain protein  54.03 
 
 		 438 aa  354  2e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231504  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2456  hypothetical protein  53.2 
 
 		 411 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146397  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2954  alanine racemase domain protein  50.87 
 
 		 400 aa  308  9e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3007  amino acid aldolase or racemase-like  48.21 
 
 		 408 aa  299  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.176851 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0670  alanine racemase domain protein  53.67 
 
 		 411 aa  292  8e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11797  hypothetical protein  47 
 
 		 411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000169265  hitchhiker  0.000017581 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31760  predicted amino acid aldolase or racemase  47.39 
 
 		 402 aa  266  5e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.316259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0593  hypothetical protein  35.85 
 
 		 390 aa  259  8e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0743387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4627  hypothetical protein  35.12 
 
 		 390 aa  249  7e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.155569  hitchhiker  0.000000000168185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0709  hypothetical protein  35.12 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0679  hypothetical protein  34.88 
 
 		 390 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0645  hypothetical protein  34.88 
 
 		 390 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0589  hypothetical protein  34.88 
 
 		 390 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0734  hypothetical protein  34.63 
 
 		 390 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02207e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0806  hypothetical protein  35.12 
 
 		 390 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0948809  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0569  hypothetical protein  34.72 
 
 		 390 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.913627  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0590  hypothetical protein  34.39 
 
 		 390 aa  244  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0746  hypothetical protein  34.39 
 
 		 402 aa  243  6e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1083  amino acid aldolase or racemase-like protein  32.21 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225982 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  28.47 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.16 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  26.52 
 
 		 384 aa  67  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  27.9 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  29.15 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  27.99 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  28.15 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  29.7 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  25.93 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  30.89 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  22.7 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  22.77 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3936  alanine racemase domain-containing protein  28.18 
 
 		 420 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.95 
 
 		 387 aa  53.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  27.92 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  28.66 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  25.38 
 
 		 382 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  28.91 
 
 		 386 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  26.89 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  29.18 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  25.17 
 
 		 349 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  26.45 
 
 		 383 aa  43.5  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0093  alanine racemase domain-containing protein  26.54 
 
 		 434 aa  43.5  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5224  hypothetical protein  25.77 
 
 		 388 aa  43.1  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>