180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1893 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1893  response regulator receiver protein  100 
 
 		 151 aa  298  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127088  hitchhiker  0.00000556231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1674  response regulator receiver protein  54.62 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3132  hypothetical protein  52.46 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1886  response regulator receiver protein  50.39 
 
 		 139 aa  133  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2074  response regulator receiver protein  63.93 
 
 		 138 aa  133  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15720  hypothetical protein  54.26 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3136  response regulator receiver protein  53.6 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2007  response regulator receiver protein  59.38 
 
 		 139 aa  130  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.270937  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1023  putative response regulator  49.59 
 
 		 143 aa  129  9e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.130012  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1581  response regulator receiver protein  49.59 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.996802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1605  response regulator receiver protein  49.59 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1551  response regulator receiver protein  49.59 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0910049  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4480  response regulator receiver protein  51.24 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179886 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1297  response regulator receiver protein  53.85 
 
 		 131 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3064  response regulator receiver protein  52.07 
 
 		 132 aa  125  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0048778  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1445  response regulator receiver protein  52.07 
 
 		 139 aa  124  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0798092  normal  0.329727 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0965  response regulator receiver protein  50.81 
 
 		 135 aa  123  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.206702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2678  response regulator receiver protein  44.88 
 
 		 138 aa  117  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.858838 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1371  response regulator receiver protein  47.11 
 
 		 136 aa  117  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13164  response regulator  45.08 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3113  response regulator receiver protein  46.34 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.630286  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10660  hypothetical protein  44 
 
 		 136 aa  115  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1805  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3167  response regulator receiver protein  49.55 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3339  putative two-component system response regulator  44.96 
 
 		 138 aa  98.2  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3247  response regulator receiver protein  40.29 
 
 		 163 aa  98.2  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00187591  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3297  hypothetical protein  45.83 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257585  normal  0.158078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3529  response regulator receiver protein  45 
 
 		 131 aa  97.8  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000118426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4121  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0402  hypothetical protein  38.28 
 
 		 135 aa  92  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  32.54 
 
 		 256 aa  51.6  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.59 
 
 		 225 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11680  two-component regulator  37.89 
 
 		 238 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2238  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  hitchhiker  0.00000354209 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.06 
 
 		 237 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1073  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 238 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4156  two component transcriptional regulator  30.89 
 
 		 232 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000307056  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  28.23 
 
 		 238 aa  47  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1162  putative two component system regulatory protein  35.37 
 
 		 233 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.95 
 
 		 227 aa  46.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1244  two component transcriptional regulator  34.15 
 
 		 228 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.683231 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  32.32 
 
 		 232 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  29.37 
 
 		 234 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.42 
 
 		 230 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  36.67 
 
 		 222 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3432  response regulator receiver protein  33.71 
 
 		 228 aa  44.7  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000345172  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3089  winged helix family two component transcriptional regulator  28.35 
 
 		 224 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0880  two component transcriptional regulator  29.17 
 
 		 236 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  35.96 
 
 		 222 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1410  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.08 
 
 		 222 aa  43.5  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.46664  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.67 
 
 		 222 aa  43.5  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0889  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 305 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  31.45 
 
 		 232 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8520  response regulator receiver protein  28.35 
 
 		 224 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5728  two component transcriptional regulator  33.85 
 
 		 280 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2225  two component transcriptional regulator  32.58 
 
 		 246 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0207  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.37 
 
 		 262 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00814931  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2311  two component transcriptional regulator  33.85 
 
 		 241 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2405  two component transcriptional regulator  33.85 
 
 		 241 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343281  normal  0.0119317 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1789  two component transcriptional regulator  33.85 
 
 		 241 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3278  two component transcriptional regulator  27.89 
 
 		 253 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0104368 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2446  two component transcriptional regulator  33.85 
 
 		 251 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.490864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2401  two component transcriptional regulator  33.85 
 
 		 241 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  31.06 
 
 		 231 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02303  two-component system regulatory protein  37.65 
 
 		 225 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.83 
 
 		 223 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3181  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.65 
 
 		 225 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 222 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  33.72 
 
 		 239 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2946  response regulator receiver protein  28.8 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  33.72 
 
 		 239 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  33.72 
 
 		 239 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  33.72 
 
 		 239 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  27.42 
 
 		 227 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  33.72 
 
 		 239 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  32.06 
 
 		 241 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  33.72 
 
 		 239 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  33.72 
 
 		 239 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 222 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0659  response regulator receiver  22.76 
 
 		 265 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.61 
 
 		 232 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2869  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5345  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.25 
 
 		 230 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4585  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.32 
 
 		 234 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.209184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  33.72 
 
 		 239 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2511  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.38 
 
 		 244 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.18 
 
 		 231 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.68 
 
 		 239 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2375  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  31.94 
 
 		 235 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277723  normal  0.133946 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0163  multi-component transcriptional regulator  29.37 
 
 		 725 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.892768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  33.72 
 
 		 239 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0005  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000487758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  33.72 
 
 		 239 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0925  DNA-binding response regulator  34.18 
 
 		 219 aa  42  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000502161  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12431  two-component response regulator, phosphate  24.24 
 
 		 242 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.15803  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.45 
 
 		 228 aa  42.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 663 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.296509  normal  0.022202 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  34.88 
 
 		 240 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1189  response regulator  35.96 
 
 		 229 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2656  two component transcriptional regulator  27.64 
 
 		 226 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  0.831438 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>