197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1869 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1869  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 335 aa  676    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.273722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2251  DeoR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 320 aa  266  5e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0678126  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0561  transcriptional regulator, DeoR family  43.91 
 
 		 322 aa  258  9e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1988  transcriptional regulator, DeoR family  42.95 
 
 		 324 aa  258  9e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000190118 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06830  transcriptional regulator  42.07 
 
 		 320 aa  249  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0488  transcriptional regulator, DeoR family  44.01 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2524  DeoR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 357 aa  229  5e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3288  transcriptional regulator, DeoR family  42.11 
 
 		 324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112061  normal  0.0190392 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29950  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  39.49 
 
 		 319 aa  205  7e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  30.41 
 
 		 315 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  30.09 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  30.63 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  30.09 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  30.09 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  30.09 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  30.09 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  29.47 
 
 		 315 aa  155  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  29.78 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  29.84 
 
 		 315 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156303  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  29.74 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  29.35 
 
 		 317 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 		 307 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  25.25 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 317 aa  105  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0409  DeoR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1160  citrate lyase regulator, putative  22.61 
 
 		 321 aa  99  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152534  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0455  HTH-type transcriptional regulator  24.1 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  23.51 
 
 		 327 aa  96.3  6e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22170  sugar-binding domain-containing protein  28.38 
 
 		 310 aa  96.7  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02313  putative transcriptional regulator  25.55 
 
 		 318 aa  96.3  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00764074  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2156  transcriptional regulator, DeoR family  26.14 
 
 		 320 aa  95.9  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  27.78 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0989  transcriptional regulator, DeoR family  25.5 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3245  sugar-binding domain-containing protein  27.96 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0904  sugar-binding domain-containing protein  27.96 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3378  DeoR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1071  transcriptional regulator, DeoR family  21.75 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0743327  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2573  putative sugar-binding region  26.49 
 
 		 337 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0753  transcriptional regulator, DeoR family  25.5 
 
 		 332 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2232  DeoR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 339 aa  94  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0728  putative transcriptional regulator  27.02 
 
 		 315 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4738  DeoR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 339 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3776  DeoR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 313 aa  93.6  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0563  SorC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 331 aa  92.8  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3753  transcriptional regulator, DeoR family  27.38 
 
 		 317 aa  92.8  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 326 aa  92.8  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3725  transcriptional regulator, DeoR family  24.43 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000852212  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0050  sorbitol operon transcriptional regulator  23.87 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00407862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2217  sugar-binding domain-containing protein  26.85 
 
 		 318 aa  92.4  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0880863 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1923  DeoR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 318 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1813  sugar-binding domain-containing protein  26.85 
 
 		 318 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0417  citrate lyase regulator  21.6 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  28.62 
 
 		 320 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1680  DeoR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.388051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2702  DeoR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 341 aa  90.5  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0090  operon regulator SmoC  26.4 
 
 		 317 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0568695  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3451  transcriptional regulator, DeoR family  27.27 
 
 		 316 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4121  DeoR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 319 aa  89.4  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0087  transcriptional regulator  24.38 
 
 		 326 aa  89.4  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.284033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4826  DeoR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 326 aa  89.4  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.658414  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4578  DeoR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.684282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3240  transcriptional regulator, DeoR family  26.65 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4358  DeoR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 339 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4444  DeoR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 339 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0599387 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1726  DeoR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06255  deoxyribonucleoside regulator/dihydroxyacetone kinase  26.67 
 
 		 333 aa  87.8  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000492  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 333 aa  87.8  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0496  DeoR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 322 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.858474  hitchhiker  0.000586642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2790  DeoR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 306 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2834  DeoR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 306 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2817  DeoR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 306 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0275474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0914  transcriptional regulator  27.33 
 
 		 317 aa  85.9  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1900  transcriptional regulator, DeoR family protein  24.15 
 
 		 320 aa  85.9  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481716  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2359  DeoR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 317 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1720  DeoR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.925466  normal  0.0186791 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2643  transcriptional regulator, DeoR family  27.63 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000047791  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0947  sugar-binding domain-containing protein  24.12 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3284  sugar-binding domain-containing protein  24.12 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3417  DeoR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330791  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3705  transcriptional regulator, DeoR family  25.64 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  22.15 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0701  transcriptional regulator, putative  26.91 
 
 		 339 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0342  transcriptional regulator, putative  26.91 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1045  putative transcriptional regulator  26.91 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4174  DeoR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0641  putative transcriptional regulator  26.91 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4152  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2476  putative transcriptional regulator  26.91 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.528896  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0883  putative transcriptional regulator  26.91 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300696  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0886  putative transcriptional regulator  26.91 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0089  putative transcriptional regulator  26.91 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.156043  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5885  DeoR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2611  DeoR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.682873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  20 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000512012  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0710  DeoR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0415966  normal  0.409033 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>