More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1799 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  100 
 
 		 162 aa  328  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  87.04 
 
 		 162 aa  291  3e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  82.1 
 
 		 162 aa  278  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  78.4 
 
 		 164 aa  253  5e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  74.69 
 
 		 162 aa  253  8e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  67.08 
 
 		 162 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  61.11 
 
 		 162 aa  203  7e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  62.89 
 
 		 184 aa  201  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  61.59 
 
 		 163 aa  197  6e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  61.49 
 
 		 161 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  59.12 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  59.01 
 
 		 166 aa  191  5e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  55 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  54.72 
 
 		 188 aa  169  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  53.75 
 
 		 182 aa  166  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  51.57 
 
 		 181 aa  166  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  51.88 
 
 		 168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  52.8 
 
 		 181 aa  160  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  51.88 
 
 		 182 aa  159  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  49.69 
 
 		 183 aa  158  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  49.69 
 
 		 186 aa  157  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  50.31 
 
 		 183 aa  157  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  49.06 
 
 		 186 aa  156  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  49.38 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  49.38 
 
 		 204 aa  154  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  47.83 
 
 		 181 aa  150  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  48.12 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  48.75 
 
 		 197 aa  148  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  45.91 
 
 		 180 aa  144  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  50 
 
 		 183 aa  141  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  48.43 
 
 		 213 aa  141  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  46.43 
 
 		 195 aa  137  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  43.93 
 
 		 192 aa  136  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  45.29 
 
 		 190 aa  134  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  51.55 
 
 		 178 aa  134  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  49.43 
 
 		 197 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  49.43 
 
 		 197 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  49.43 
 
 		 197 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  45.51 
 
 		 197 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  47.02 
 
 		 182 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  45.51 
 
 		 197 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  45.51 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  39.71 
 
 		 230 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  47.62 
 
 		 191 aa  128  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  44.05 
 
 		 230 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  45.2 
 
 		 198 aa  125  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  46.51 
 
 		 188 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  44.81 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  42.26 
 
 		 213 aa  124  8.000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3120  peptide deformylase  50.34 
 
 		 177 aa  122  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  40.25 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  42.14 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  40.88 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  45.73 
 
 		 200 aa  116  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5928  Peptide deformylase  42.04 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.0170344 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  41.61 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  43.79 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  41.5 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  44.38 
 
 		 221 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  41.1 
 
 		 147 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  40.26 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  40.94 
 
 		 167 aa  110  6e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  40.27 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  40.27 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  40 
 
 		 170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  39.73 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  40.25 
 
 		 225 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0038  peptide deformylase  40.14 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  35.98 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  40.4 
 
 		 154 aa  107  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  39.02 
 
 		 177 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  42.95 
 
 		 190 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  39.31 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  36.48 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  41.96 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  36.08 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  38.61 
 
 		 173 aa  104  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  39.75 
 
 		 199 aa  104  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  38.67 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  40.51 
 
 		 227 aa  104  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  41.14 
 
 		 200 aa  104  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3726  peptide deformylase  36.02 
 
 		 167 aa  103  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  36.09 
 
 		 171 aa  103  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  36.59 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  38.31 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  38.71 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  35.37 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  38.51 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  41.4 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0024  peptide deformylase  35.54 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  39.1 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  38.96 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  35.98 
 
 		 168 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  38.67 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  37.35 
 
 		 168 aa  101  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  35.98 
 
 		 168 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  35.98 
 
 		 168 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  38.67 
 
 		 158 aa  100  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  37.5 
 
 		 168 aa  100  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  39.33 
 
 		 156 aa  100  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>