53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1778 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1778  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  499  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00279828  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1417  hypothetical protein  61.42 
 
 
254 aa  308  5.9999999999999995e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2268  hypothetical protein  62.6 
 
 
256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1506  hypothetical protein  47.24 
 
 
263 aa  221  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.168782 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2327  hypothetical protein  45.53 
 
 
267 aa  209  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.398792  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  45.53 
 
 
267 aa  208  7e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000089392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7017  hypothetical protein  46.39 
 
 
291 aa  207  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320155 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15480  hypothetical protein  43.14 
 
 
276 aa  207  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00643859  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2774  hypothetical protein  47.67 
 
 
269 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  39.76 
 
 
270 aa  177  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2000  hypothetical protein  37.35 
 
 
271 aa  169  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.422215  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1720  hypothetical protein  36.36 
 
 
271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10540  hypothetical protein  40.64 
 
 
288 aa  153  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11001  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2221  hypothetical protein  34.41 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986001  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22150  hypothetical protein  34.24 
 
 
263 aa  128  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0416254  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  36.36 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3063  hypothetical protein  36.43 
 
 
264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.129455 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2063  hypothetical protein  32.71 
 
 
270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3150  hypothetical protein  35.71 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2017  hypothetical protein  32.71 
 
 
270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3200  hypothetical protein  35.71 
 
 
268 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  0.212983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3138  hypothetical protein  35.71 
 
 
268 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1998  hypothetical protein  32.81 
 
 
262 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  33.98 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  33.96 
 
 
268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0667  hypothetical protein  33.73 
 
 
276 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  33.46 
 
 
264 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  30.6 
 
 
276 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2151  hypothetical protein  31.91 
 
 
276 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  29.81 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  29.85 
 
 
257 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2983  hypothetical protein  28.02 
 
 
258 aa  92  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  30.15 
 
 
280 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  27.78 
 
 
265 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  28.73 
 
 
269 aa  89  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  30.3 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2455  hypothetical protein  33.59 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  27.14 
 
 
257 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  29.77 
 
 
263 aa  85.9  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0766  hypothetical protein  29.18 
 
 
267 aa  85.1  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2330  hypothetical protein  29.28 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0454  hypothetical protein  27.92 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0043  hypothetical protein  29.89 
 
 
276 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257103  normal  0.0357536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0062  hypothetical protein  29.89 
 
 
276 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.847776  normal  0.0297452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0053  hypothetical protein  29.89 
 
 
276 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0984909  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0790  hypothetical protein  28.57 
 
 
268 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3647  hypothetical protein  26.4 
 
 
265 aa  52.4  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.51576  hitchhiker  0.00000000000126361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  25.56 
 
 
272 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  25.1 
 
 
277 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2565  hypothetical protein  24.7 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2573  hypothetical protein  24.7 
 
 
270 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2528  hypothetical protein  24.7 
 
 
270 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4522  hypothetical protein  23.53 
 
 
284 aa  42.7  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>