248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1748 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 
351 aa  683    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  66.48 
 
 
340 aa  419  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  65.62 
 
 
341 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  62.25 
 
 
343 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  64.39 
 
 
346 aa  389  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  60.91 
 
 
337 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  60.11 
 
 
337 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  59.83 
 
 
346 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  59.43 
 
 
337 aa  375  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  60.06 
 
 
340 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  57.88 
 
 
343 aa  371  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  60.17 
 
 
337 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.55 
 
 
337 aa  368  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  59.89 
 
 
339 aa  369  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.46 
 
 
340 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  57.83 
 
 
337 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  56.03 
 
 
340 aa  362  4e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  57.26 
 
 
339 aa  362  7.0000000000000005e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.18 
 
 
340 aa  360  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  56.98 
 
 
339 aa  359  3e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  58.17 
 
 
351 aa  360  3e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  58.17 
 
 
340 aa  358  9.999999999999999e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  55.68 
 
 
341 aa  356  3.9999999999999996e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  55.27 
 
 
339 aa  354  1e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  54.29 
 
 
340 aa  342  7e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12370  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.43 
 
 
337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0321909  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  52.39 
 
 
347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  52.39 
 
 
347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  52.39 
 
 
347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  51.42 
 
 
343 aa  334  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  54.21 
 
 
350 aa  333  2e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  51.57 
 
 
343 aa  329  3e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  51.42 
 
 
344 aa  325  8.000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  52.26 
 
 
344 aa  322  9.000000000000001e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  49.43 
 
 
343 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  51.44 
 
 
336 aa  311  7.999999999999999e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  44.18 
 
 
372 aa  272  7e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.98 
 
 
345 aa  253  5.000000000000001e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.04 
 
 
347 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.21 
 
 
337 aa  192  7e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  35.51 
 
 
336 aa  192  8e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.56 
 
 
351 aa  188  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 
345 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.27 
 
 
344 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  36.8 
 
 
336 aa  186  5e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.18 
 
 
343 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.07 
 
 
343 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  31.93 
 
 
344 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.23 
 
 
343 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.57 
 
 
342 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.26 
 
 
343 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.97 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.3 
 
 
341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.48 
 
 
343 aa  173  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  30.17 
 
 
339 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.01 
 
 
347 aa  172  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.52 
 
 
343 aa  172  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  30.51 
 
 
344 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  30.17 
 
 
339 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  32.39 
 
 
339 aa  170  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.52 
 
 
344 aa  169  9e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.17 
 
 
348 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.66 
 
 
344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.18 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.37 
 
 
344 aa  162  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0187  heat-inducible transcription repressor  35.26 
 
 
362 aa  162  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  34.28 
 
 
352 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2842  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.44 
 
 
342 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.07 
 
 
354 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.66 
 
 
343 aa  161  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.79 
 
 
345 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.01 
 
 
357 aa  160  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.8 
 
 
350 aa  159  9e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.14 
 
 
343 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.05 
 
 
355 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  34.28 
 
 
342 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.61 
 
 
353 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.15 
 
 
357 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.61 
 
 
353 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1661  heat-inducible transcription repressor  33.15 
 
 
365 aa  156  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10502  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  32.22 
 
 
349 aa  155  7e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  35.39 
 
 
334 aa  155  8e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  35.11 
 
 
334 aa  155  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0152  heat-inducible transcription repressor  34.17 
 
 
362 aa  155  9e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.86 
 
 
363 aa  155  9e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  36.16 
 
 
367 aa  155  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.62 
 
 
359 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1133  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.06 
 
 
365 aa  154  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.382582  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0194  heat-inducible transcription repressor  34.64 
 
 
362 aa  153  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.636083  normal  0.88181 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  28.05 
 
 
338 aa  153  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.53 
 
 
359 aa  153  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  26.97 
 
 
343 aa  153  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  27.76 
 
 
338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  27.76 
 
 
338 aa  152  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0333  heat-inducible transcription repressor  34.45 
 
 
362 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0187094  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  27.76 
 
 
338 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  27.76 
 
 
338 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0326  heat-inducible transcription repressor  34.45 
 
 
362 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  29.81 
 
 
360 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2696  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.6 
 
 
376 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.666448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>