More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1740 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  100 
 
 
86 aa  167  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  76.74 
 
 
86 aa  126  1e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  74.42 
 
 
88 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  81.4 
 
 
86 aa  121  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  79.07 
 
 
86 aa  121  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  75 
 
 
88 aa  120  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  80.23 
 
 
86 aa  118  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  73.26 
 
 
89 aa  117  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  76.54 
 
 
107 aa  116  1e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  74.39 
 
 
86 aa  114  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  67.44 
 
 
86 aa  113  7e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  68.6 
 
 
86 aa  108  2e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53249e-08 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  68.6 
 
 
88 aa  107  4e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  69.77 
 
 
86 aa  107  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  77.33 
 
 
86 aa  107  7e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  68.6 
 
 
89 aa  107  8e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  69.05 
 
 
86 aa  105  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  69.77 
 
 
92 aa  106  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  70.24 
 
 
86 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  67.44 
 
 
86 aa  104  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  69.77 
 
 
90 aa  104  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  65.12 
 
 
86 aa  104  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  68.75 
 
 
86 aa  103  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  68.75 
 
 
86 aa  103  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  68.75 
 
 
86 aa  103  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  69.88 
 
 
86 aa  103  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  65.12 
 
 
88 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  65.12 
 
 
88 aa  101  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  69.77 
 
 
86 aa  101  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  67.44 
 
 
90 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  71.6 
 
 
162 aa  100  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  1.27538e-06  unclonable  1.13677e-09 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  70.89 
 
 
95 aa  100  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  60.47 
 
 
86 aa  99.8  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  68.6 
 
 
86 aa  97.8  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  67.53 
 
 
151 aa  96.7  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  65.12 
 
 
87 aa  96.3  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12430  SSU ribosomal protein S20P  72.09 
 
 
88 aa  95.9  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0372924  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0854  ribosomal protein S20  65.12 
 
 
86 aa  94  6e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1614  ribosomal protein S20  68.6 
 
 
88 aa  92.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1654  ribosomal protein S20  64.56 
 
 
167 aa  90.1  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.158748  hitchhiker  0.00316633 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07740  ribosomal protein S20  65.43 
 
 
172 aa  83.6  8e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.603346 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  53.57 
 
 
89 aa  80.1  1e-14  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 
89 aa  78.6  3e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.40091e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  51.76 
 
 
85 aa  78.6  3e-14  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0583  30S ribosomal protein S20  63.95 
 
 
86 aa  78.2  4e-14  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  50 
 
 
89 aa  77.4  6e-14  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  51.16 
 
 
95 aa  77.4  7e-14  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  50.59 
 
 
85 aa  76.6  1e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.91712e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  50.59 
 
 
85 aa  76.6  1e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.53456e-13 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  50.59 
 
 
85 aa  76.6  1e-13  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  50.59 
 
 
85 aa  76.6  1e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  50.59 
 
 
85 aa  76.6  1e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  50.59 
 
 
85 aa  76.6  1e-13  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.15322e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  50.59 
 
 
85 aa  76.6  1e-13  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  50.59 
 
 
85 aa  76.6  1e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  53.49 
 
 
87 aa  75.9  2e-13  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.04078e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  49.41 
 
 
85 aa  75.1  3e-13  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  1.17943e-11 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  49.41 
 
 
85 aa  74.3  5e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  51.19 
 
 
88 aa  72  2e-12  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  47.06 
 
 
85 aa  72  3e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  1.76977e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
88 aa  70.9  6e-12  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
88 aa  70.5  8e-12  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 
87 aa  70.1  9e-12  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 
87 aa  70.1  9e-12  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 
87 aa  69.7  1e-11  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  5.8734e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  45.56 
 
 
99 aa  69.7  1e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 
96 aa  69.7  1e-11  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  3.00859e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 
88 aa  68.9  2e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2044  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 
86 aa  69.3  2e-11  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  46.51 
 
 
88 aa  68.2  3e-11  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 
87 aa  68.6  3e-11  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  48.84 
 
 
84 aa  67.8  5e-11  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  1.67926e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  47.67 
 
 
88 aa  67.8  5e-11  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  5.91631e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  46.51 
 
 
88 aa  67.8  5e-11  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  50 
 
 
87 aa  67.4  6e-11  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.31209e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
86 aa  67.4  6e-11  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 
88 aa  67  7e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  7.73203e-15  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 
88 aa  67.4  7e-11  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 
88 aa  67.4  7e-11  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0582  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
87 aa  67  9e-11  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  1.60392e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  48.86 
 
 
98 aa  66.6  9e-11  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
88 aa  66.6  1e-10  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
88 aa  66.2  1e-10  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  2.94185e-06  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
88 aa  66.2  1e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  41.86 
 
 
88 aa  66.6  1e-10  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
88 aa  66.2  1e-10  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  4.08096e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
88 aa  66.2  1e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  2.04572e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 
87 aa  66.2  1e-10  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  4.43906e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  48.84 
 
 
88 aa  65.9  2e-10  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  46.84 
 
 
105 aa  65.9  2e-10  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 
88 aa  65.9  2e-10  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
88 aa  65.5  2e-10  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  7.11095e-08  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  43.02 
 
 
86 aa  65.5  2e-10  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  2.07001e-09  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
88 aa  65.5  2e-10  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.0022e-08  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  49.38 
 
 
100 aa  65.9  2e-10  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 
96 aa  65.9  2e-10  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  5.67629e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  42.35 
 
 
115 aa  65.9  2e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  5.62255e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  48.78 
 
 
90 aa  65.5  2e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.59944e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
88 aa  65.5  2e-10  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
88 aa  65.5  2e-10  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  3.22066e-06  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>