More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1698 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 447 aa  899    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  47.14 
 
 		 455 aa  392  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  42.06 
 
 		 445 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  30.24 
 
 		 456 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  29.43 
 
 		 410 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  28.97 
 
 		 410 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 410 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  28.67 
 
 		 403 aa  113  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  28.67 
 
 		 430 aa  111  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.96 
 
 		 407 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  30.12 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  29.76 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 411 aa  100  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 466 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 461 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 		 442 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  29.67 
 
 		 425 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 454 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  27.61 
 
 		 416 aa  90.5  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0069  twin-arginine translocation pathway signal  26.06 
 
 		 432 aa  89.7  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  26.72 
 
 		 422 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4930  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 		 419 aa  87.4  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.265943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 		 420 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2649  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 		 400 aa  86.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 		 458 aa  86.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  30.68 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1955  extracellular solute-binding protein family 1  31.14 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.974693  hitchhiker  0.000475348 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  30.22 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.48 
 
 		 426 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.59 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  22.96 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  29 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 		 504 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  28.72 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.53 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4148  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 426 aa  79.7  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  26.59 
 
 		 422 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01810  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.99 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  25.29 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  25.29 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  28.68 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0508  extracellular solute-binding protein family 1  23.35 
 
 		 514 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3000  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  27.78 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1711  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 		 454 aa  76.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.795485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  26.74 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 431 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  27.14 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  26.61 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3595  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931004  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  25.76 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.76 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  28.36 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  21.97 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  30.96 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.94 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1138  extracellular solute-binding protein family 1  29.85 
 
 		 423 aa  73.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  27.86 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  28.29 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4883  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.93 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134037  normal  0.0630481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1807  extracellular solute-binding protein family 1  27.45 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07110  carbohydrate-binding protein  22.97 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.38 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3956  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.74 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  0.0187852 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2420  extracellular solute-binding protein  29.47 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.783182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  29.47 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 431 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2459  extracellular solute-binding protein  29.47 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.924766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 		 460 aa  69.3  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  28.09 
 
 		 420 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4695  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.52565 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>