More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1680 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
430 aa  848    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  30.21 
 
 
423 aa  153  5e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  29.83 
 
 
406 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  32.35 
 
 
442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  31 
 
 
411 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  29.19 
 
 
504 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  29.43 
 
 
436 aa  130  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  30.73 
 
 
410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  27.82 
 
 
416 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  28.94 
 
 
432 aa  127  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  27.44 
 
 
456 aa  126  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  28.25 
 
 
427 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.44 
 
 
407 aa  125  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 
424 aa  123  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  29.88 
 
 
410 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 
457 aa  121  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  29.62 
 
 
423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  31.45 
 
 
453 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  29.97 
 
 
417 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 
410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  29.38 
 
 
404 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 
424 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 
411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  28.37 
 
 
411 aa  117  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4930  extracellular solute-binding protein family 1  32.42 
 
 
419 aa  117  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.265943  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.86 
 
 
366 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  31.52 
 
 
445 aa  116  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 
461 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3842  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 
429 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0316121  normal  0.0422385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 
410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  28.05 
 
 
427 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  28.64 
 
 
441 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  30.49 
 
 
410 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.91 
 
 
431 aa  113  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  28.38 
 
 
421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 
415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 
445 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 
411 aa  111  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 
412 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 
415 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 
455 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  27.93 
 
 
444 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  29.92 
 
 
438 aa  109  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.88 
 
 
430 aa  109  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  27.61 
 
 
432 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  27.64 
 
 
422 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  29.4 
 
 
447 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 
422 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 
426 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 
420 aa  107  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
421 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
433 aa  106  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  28.33 
 
 
410 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  28.35 
 
 
421 aa  106  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  27.94 
 
 
443 aa  106  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 
414 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 
414 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 
410 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 
414 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 
445 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 
408 aa  103  8e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0832  multiple sugar transport system substrate-binding protein  27.23 
 
 
416 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.669088  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 
427 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 
419 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  29.55 
 
 
411 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 
420 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 
442 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 
399 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  28.94 
 
 
429 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  23.22 
 
 
416 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 
420 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  23.68 
 
 
416 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  26.98 
 
 
410 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  26.98 
 
 
410 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 
441 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 
443 aa  99.4  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 
397 aa  99  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.22 
 
 
420 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 
466 aa  97.1  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  25.84 
 
 
428 aa  97.1  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  26.9 
 
 
414 aa  96.7  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 
433 aa  96.3  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 
417 aa  95.9  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 
449 aa  95.9  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  26.67 
 
 
434 aa  95.1  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  27.78 
 
 
403 aa  95.5  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3566  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 
426 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 
441 aa  94  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1269  extracellular solute-binding protein family 1  28.15 
 
 
412 aa  94  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 
425 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0791  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 
399 aa  93.6  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 
443 aa  93.2  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 
419 aa  93.2  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 
415 aa  92.8  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 
403 aa  92.4  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6794  extracellular solute-binding protein family 1  28.62 
 
 
430 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 
413 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1807  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 
402 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>