More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1517 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1517  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
225 aa  442  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2372  transcriptional regulator, GntR family  46.92 
 
 
225 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000612735  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1711  GntR family transcriptional regulator  42.38 
 
 
226 aa  158  8e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.968918  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  41.06 
 
 
223 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1252  transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 
232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.148319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0156  gluconate operon transcriptional repressor  31.31 
 
 
243 aa  105  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0154  gluconate operon transcriptional repressor  31.31 
 
 
243 aa  105  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0205  gluconate operon transcriptional repressor  34.52 
 
 
243 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0162  gluconate operon transcriptional repressor  31.31 
 
 
243 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0161  gluconate operon transcriptional repressor  31.31 
 
 
243 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0183  gluconate operon transcriptional repressor  31.31 
 
 
243 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 
242 aa  102  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2582  gluconate operon transcriptional repressor  36.22 
 
 
226 aa  102  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.623222  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2530  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
226 aa  102  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
229 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
217 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2059  gluconate operon transcriptional repressor  31.16 
 
 
226 aa  99.4  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 
227 aa  99.4  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
219 aa  98.6  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 
233 aa  97.1  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 
223 aa  95.9  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
235 aa  95.5  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 
231 aa  94  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 
219 aa  92.8  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  36.77 
 
 
222 aa  92.8  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 
226 aa  92.4  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0394  transcriptional regulator, GntR family  34.47 
 
 
250 aa  92  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.143272  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  34.6 
 
 
238 aa  92  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
223 aa  91.7  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  35.47 
 
 
235 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
267 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  32.87 
 
 
229 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 
229 aa  89.7  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 
219 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 
229 aa  89.7  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3959  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
219 aa  89.4  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.426708  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
229 aa  89  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
260 aa  88.6  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
233 aa  88.2  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  37.85 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 
234 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
267 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  37.17 
 
 
232 aa  87.4  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 
222 aa  86.7  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
222 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  36.87 
 
 
215 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
225 aa  86.7  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
233 aa  86.3  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4133  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
231 aa  86.3  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 
223 aa  86.3  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  35.55 
 
 
214 aa  85.9  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
247 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
230 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
234 aa  85.1  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 
227 aa  84.7  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  35.11 
 
 
217 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
230 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  30.54 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1564  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123193  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2466  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
213 aa  82  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 
242 aa  82  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1244  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
211 aa  82  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4314  transcriptional regulator, GntR family  34.25 
 
 
243 aa  82  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
242 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
229 aa  81.6  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
257 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 
232 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  27.98 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  34.13 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  31 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  32.39 
 
 
231 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1061  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
227 aa  79  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
241 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5240  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 
227 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4146  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10084  normal  0.977946 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3893  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000000224678  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
242 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  35.94 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>