More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1486 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
241 aa  485  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.727774  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 
250 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 
257 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 
257 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 
257 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 
250 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553116  normal  0.644711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  42.45 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal  0.103076 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  42.28 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  42.62 
 
 
257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
251 aa  162  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
257 aa  162  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.560297 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
252 aa  161  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2281  short chain dehydrogenase  42.62 
 
 
257 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
260 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.730129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8214  short chain dehydrogenase  42.92 
 
 
248 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
253 aa  159  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562893  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00620  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  43.59 
 
 
260 aa  159  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.297652  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
248 aa  159  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
256 aa  158  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.254174 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.84 
 
 
246 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.368584  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  40.73 
 
 
259 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.51 
 
 
246 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.85 
 
 
251 aa  156  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
257 aa  156  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759988  normal  0.0474831 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  40 
 
 
258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.69 
 
 
246 aa  155  6e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.67 
 
 
244 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742877  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
252 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
261 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.29 
 
 
245 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00987994  normal  0.377928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.35 
 
 
255 aa  152  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.843425  normal  0.851299 
 
 
-
 
NC_004310  BR0243  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40 
 
 
244 aa  152  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.550186  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
255 aa  152  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0788  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
244 aa  152  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
255 aa  152  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0236  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40 
 
 
244 aa  152  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.117254  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.36 
 
 
250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2957  putative short-chain dehydrogenase/reductase  39.83 
 
 
247 aa  151  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5050  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.03 
 
 
230 aa  151  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.654307 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
261 aa  151  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.17 
 
 
260 aa  151  8e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
256 aa  150  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
249 aa  150  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.506283  normal  0.100596 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.35 
 
 
255 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00771979  normal  0.364643 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
251 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4826  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
244 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.806753 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
251 aa  150  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00370  fatty acid beta-oxidation-related protein, putative  39.38 
 
 
292 aa  149  3e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.170907  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
245 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
247 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214979  normal  0.444362 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
244 aa  149  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475551  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0197  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.1 
 
 
245 aa  149  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 
257 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5056  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
249 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
255 aa  149  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
254 aa  149  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
256 aa  149  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
253 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
246 aa  149  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  39.68 
 
 
257 aa  149  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1381  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.55 
 
 
248 aa  149  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.049098  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
251 aa  149  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000407954 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.71 
 
 
239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1081  oxidoreductase, putative short-chain alcohol dehydrogenase  40.16 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3961  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.985096  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0167  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.69 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.619009  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.28835 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.47 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000395  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  38.21 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.36672  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
249 aa  146  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  34.27 
 
 
247 aa  146  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 
244 aa  146  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.372052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1634  short chain dehydrogenase  40.41 
 
 
265 aa  146  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213832  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.233538  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  37.2 
 
 
256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1604  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.32 
 
 
247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1800  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 
260 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.837228 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
250 aa  145  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
262 aa  145  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.37 
 
 
247 aa  145  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  34.01 
 
 
247 aa  145  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.95 
 
 
249 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.186912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.63 
 
 
271 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.1246  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  38.78 
 
 
254 aa  144  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3256  malate/L-lactate dehydrogenase  37.45 
 
 
247 aa  144  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0180309  normal  0.2268 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.17 
 
 
269 aa  144  9e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4572  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  38 
 
 
258 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
253 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
256 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
242 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0353846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4649  short chain dehydrogenase  36.61 
 
 
261 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 
251 aa  144  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.677514  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  34.54 
 
 
249 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.01 
 
 
247 aa  144  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>