38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1445 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1445  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 
203 aa  396  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03470  DNA-binding protein, excisionase family  45.83 
 
 
178 aa  85.9  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20770  DNA-binding protein, excisionase family  48.86 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04840  DNA-binding protein, excisionase family  43.62 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287147  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1635  DNA binding domain protein, excisionase family  36.09 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3752  DNA binding domain protein, excisionase family  43.18 
 
 
153 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2993  DNA binding domain protein, excisionase family  38.26 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13782  excisionase  36.84 
 
 
130 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.696326 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3239  putative excisionase protein  35.78 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0263514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1856  excisionase/Xis, DNA-binding  40 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4630  DNA binding domain-containing protein  39.18 
 
 
109 aa  68.9  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0047  DNA binding domain, excisionase family  41.12 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509276  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2889  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  46.15 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3385  DNA binding domain-containing protein  33.62 
 
 
150 aa  67.4  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3978  DNA binding domain-containing protein  35 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.382776 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2344  excisionase/Xis, DNA-binding  38.61 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000412399  unclonable  0.000000144936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1265  DNA binding domain-containing protein  38.61 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8221  DNA binding domain-containing protein  39.81 
 
 
149 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4162  DNA binding domain-containing protein  40.96 
 
 
155 aa  63.2  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0766794  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2639  hypothetical protein  35.58 
 
 
153 aa  62.8  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690971  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3464  DNA binding domain protein, excisionase family  31.39 
 
 
157 aa  62  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4367  DNA binding domain-containing protein  36.17 
 
 
155 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.264021  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4151  excisionase domain-containing protein  37.5 
 
 
157 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12334  excisionase  40.43 
 
 
114 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3279  DNA binding domain-containing protein  34.86 
 
 
149 aa  59.7  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.746198  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0695  DNA binding domain-containing protein  33.64 
 
 
153 aa  57.4  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0623453  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0234  DNA binding domain protein, excisionase family  31.73 
 
 
154 aa  55.5  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.844329  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1614  excisionase domain protein  31.73 
 
 
154 aa  55.1  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177236  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4435  DNA binding domain-containing protein  27.73 
 
 
149 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.901637  normal  0.560095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0072  DNA binding domain protein, excisionase family  33 
 
 
141 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3924  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 
152 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1776  excisionase/Xis, DNA-binding  31.58 
 
 
97 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.666085  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0338  DNA binding domain-containing protein  40.28 
 
 
153 aa  48.9  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4424  excisionase/Xis, DNA-binding  39.24 
 
 
152 aa  48.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.412812  normal  0.513103 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1504  DNA binding domain protein, excisionase family  31.58 
 
 
151 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7903  DNA binding domain protein, excisionase family  29.03 
 
 
151 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0793  DNA binding domain protein, excisionase family  42.67 
 
 
178 aa  45.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4763  excisionase/Xis, DNA-binding  29.87 
 
 
158 aa  42.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.180211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>