156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1428 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1428  biotin/lipoate A/B protein ligase  100 
 
 		 354 aa  707    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  67.51 
 
 		 349 aa  479  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  60.73 
 
 		 349 aa  439  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  60.91 
 
 		 372 aa  426  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  62.99 
 
 		 349 aa  424  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1879  biotin/lipoate A/B protein ligase  61.58 
 
 		 365 aa  421  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459014 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  57.91 
 
 		 349 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  62.36 
 
 		 358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09720  lipoate-protein ligase A  58.26 
 
 		 364 aa  398  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331543  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  59.34 
 
 		 358 aa  395  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.260617 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11650  lipoate-protein ligase A  55.08 
 
 		 352 aa  379  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  63.04 
 
 		 261 aa  327  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  58.59 
 
 		 257 aa  314  9.999999999999999e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  59.14 
 
 		 261 aa  309  5e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0450  biotin/lipoate A/B protein ligase  53.67 
 
 		 259 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0980  lipoate-protein ligase A  55.87 
 
 		 253 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02600  hypothetical protein  53.57 
 
 		 220 aa  139  8.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  34.92 
 
 		 245 aa  123  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  28.63 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.6 
 
 		 530 aa  97.4  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0052  lipoate-protein ligase  31.65 
 
 		 333 aa  95.9  9e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.87 
 
 		 326 aa  95.9  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  28.46 
 
 		 336 aa  95.1  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  27.31 
 
 		 332 aa  94.4  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  30.21 
 
 		 327 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  26.34 
 
 		 334 aa  93.6  5e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0931  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.45 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000248179  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.63 
 
 		 360 aa  90.5  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  27.64 
 
 		 326 aa  89.7  6e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3412  hypothetical protein  53.54 
 
 		 94 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.010842  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.42 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0964  hypothetical protein  52.58 
 
 		 91 aa  87.4  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.27883  normal  0.241278 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0451  hypothetical protein  55.67 
 
 		 92 aa  87  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3768  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  30.34 
 
 		 329 aa  86.3  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1515  hypothetical protein  56.84 
 
 		 94 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.648993  hitchhiker  0.00942142 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0967  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.24 
 
 		 278 aa  85.9  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.170763  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.55 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.55 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  23.64 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  29.27 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05080  lipoate-protein ligase  25.59 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.341449  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0187  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.3 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.25 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  24.59 
 
 		 334 aa  82.4  0.00000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0070  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  31.16 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2805  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.54 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.81 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  unclonable  0.000000010218 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.64 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1002  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.88 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1014  lipoate-protein ligase  23.79 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00464071  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2173  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.56 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.679039  decreased coverage  0.000000000726509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2545  lipoate-protein ligase A, putative  27.56 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  25.81 
 
 		 278 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  25.45 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  25.81 
 
 		 278 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  25.81 
 
 		 278 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  25.45 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  25.81 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  25.81 
 
 		 278 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  25.81 
 
 		 278 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.09 
 
 		 278 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  25.45 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1542  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.57 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2894  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.1 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1560  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.64 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0396798 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0847  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.1 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.918447  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2663  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.53 
 
 		 275 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1053  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.83 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0882  lipoate-protein ligase A  24.76 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1677  lipoate-protein ligase  29.63 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0374805  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  24.8 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.51 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  25.12 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  25.2 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0224  lipoate-protein ligase  22.58 
 
 		 334 aa  72  0.00000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  25.1 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  25.2 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0379  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  26.87 
 
 		 269 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  25.2 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  25.2 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  25.2 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  25.2 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  25.2 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  25.2 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0197  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.3 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0881  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.24 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0333925  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4028  lipoate-protein ligase A  29.09 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  24.8 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1506  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.24 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1551  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  24.88 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.23083  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.23 
 
 		 278 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2086  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.58 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0532  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.88 
 
 		 269 aa  69.3  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.870204 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2611  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.86 
 
 		 253 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5901  unknown domain/lipoate-protein ligase A fusion protein  28.32 
 
 		 562 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1733  lipoate-protein ligase A  28.77 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2867  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.97 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2604  lipoate-protein ligase A  28.77 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1839  lipoate-protein ligase A  28.77 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>