More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1423 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 195 aa  384  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  67.37 
 
 		 215 aa  253  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  66.67 
 
 		 202 aa  252  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  67.21 
 
 		 198 aa  250  8.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  65.61 
 
 		 201 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  68.11 
 
 		 195 aa  240  9e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  66.49 
 
 		 196 aa  240  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  63.16 
 
 		 201 aa  236  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  64.29 
 
 		 194 aa  236  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  63.1 
 
 		 197 aa  236  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  59.28 
 
 		 219 aa  228  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  65.38 
 
 		 200 aa  225  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1719  transcriptional regulator, XRE family  64.06 
 
 		 204 aa  223  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.017651  normal  0.124941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  61.08 
 
 		 200 aa  220  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1965  XRE family transcriptional regulator  63.04 
 
 		 194 aa  220  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0249499  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  63.64 
 
 		 192 aa  219  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  61.62 
 
 		 191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  60.11 
 
 		 191 aa  217  8.999999999999998e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  61.08 
 
 		 191 aa  216  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  60.44 
 
 		 223 aa  214  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  60.56 
 
 		 192 aa  214  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  62.3 
 
 		 194 aa  212  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  56.12 
 
 		 199 aa  211  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2592  transcriptional regulator, XRE family  65.26 
 
 		 210 aa  209  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  55.38 
 
 		 198 aa  202  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1667  XRE family transcriptional regulator  62.84 
 
 		 214 aa  200  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  54.74 
 
 		 197 aa  194  9e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  52.26 
 
 		 197 aa  192  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  54.44 
 
 		 190 aa  184  6e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1711  transcriptional regulator, XRE family  55.43 
 
 		 200 aa  171  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63161  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2365  transcriptional regulator, XRE family  53.99 
 
 		 193 aa  155  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.0272358 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  48.88 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  48.88 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  48.88 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4050  transcriptional regulator, XRE family  46.47 
 
 		 192 aa  132  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3617  XRE family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 195 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2893  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 169 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  39.46 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2586  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.83 
 
 		 126 aa  106  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000628471  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  39.78 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  38.86 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  38.89 
 
 		 190 aa  95.5  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  36.93 
 
 		 198 aa  94.4  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  39.77 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2440  transcriptional regulator, XRE family  35.86 
 
 		 220 aa  85.9  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086441  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  31.18 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  33.71 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  32.07 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04250  transcriptional regulator  37.71 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4609  XRE family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 229 aa  72  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 182 aa  72  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5123  hypothetical protein  31.38 
 
 		 198 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0869  XRE family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  31.69 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  31.46 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 292 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0477  XRE family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  32.69 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  26.92 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  26.92 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0556  MerR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  26.92 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  31.52 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3046  transcriptional regulator  30.11 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  25.93 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  27.22 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  31.52 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  30.46 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1227  transcriptional regulator  30.37 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0062  transcriptional regulator  28.93 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  25.53 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  50.67 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  27.27 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>