More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1369 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 521 aa  977    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  51.56 
 
 		 517 aa  411  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  50.5 
 
 		 584 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 521 aa  395  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  48.45 
 
 		 528 aa  397  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  46.17 
 
 		 562 aa  393  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  44.83 
 
 		 518 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  47.46 
 
 		 526 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  45.94 
 
 		 535 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  46.76 
 
 		 529 aa  382  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  50.88 
 
 		 503 aa  385  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  47.38 
 
 		 555 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  49 
 
 		 513 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  47.56 
 
 		 501 aa  373  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  45.42 
 
 		 524 aa  375  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  43.78 
 
 		 509 aa  369  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  46.06 
 
 		 541 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  46.99 
 
 		 509 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  47.67 
 
 		 601 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  50.2 
 
 		 513 aa  372  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  50.42 
 
 		 588 aa  371  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  44.32 
 
 		 514 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  48.5 
 
 		 554 aa  366  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  46.89 
 
 		 508 aa  364  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  47.56 
 
 		 575 aa  364  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  44.31 
 
 		 532 aa  361  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  45.73 
 
 		 509 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  45.66 
 
 		 558 aa  357  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  47.33 
 
 		 563 aa  355  1e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  44.54 
 
 		 528 aa  354  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  48.37 
 
 		 539 aa  352  7e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  44.99 
 
 		 516 aa  352  8e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  50.32 
 
 		 481 aa  352  8.999999999999999e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  50.39 
 
 		 496 aa  352  1e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  45.97 
 
 		 536 aa  351  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  47.86 
 
 		 516 aa  337  3.9999999999999995e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  46.86 
 
 		 540 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  49.79 
 
 		 513 aa  336  5.999999999999999e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  43 
 
 		 519 aa  335  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 		 553 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  46.31 
 
 		 508 aa  332  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.9 
 
 		 537 aa  330  5.0000000000000004e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  45.84 
 
 		 525 aa  329  7e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  45.84 
 
 		 525 aa  329  7e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  45.84 
 
 		 525 aa  329  7e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  45 
 
 		 533 aa  327  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  47.87 
 
 		 524 aa  326  5e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  45.33 
 
 		 505 aa  325  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  48.39 
 
 		 502 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  48.55 
 
 		 477 aa  323  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  41.82 
 
 		 490 aa  321  1.9999999999999998e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  43.23 
 
 		 509 aa  317  3e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  46.75 
 
 		 506 aa  315  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  48.05 
 
 		 528 aa  309  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  41.91 
 
 		 517 aa  306  8.000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  44.66 
 
 		 535 aa  302  8.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  42.92 
 
 		 514 aa  295  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  41.04 
 
 		 511 aa  292  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  41.41 
 
 		 516 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  42.19 
 
 		 516 aa  286  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  38.49 
 
 		 520 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  44.35 
 
 		 497 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  40.08 
 
 		 492 aa  284  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  39.66 
 
 		 504 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  44.8 
 
 		 536 aa  280  6e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.25 
 
 		 525 aa  279  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  40.89 
 
 		 517 aa  276  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  39.36 
 
 		 510 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  38.2 
 
 		 503 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.87 
 
 		 534 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  45.56 
 
 		 528 aa  266  5e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  38.15 
 
 		 503 aa  262  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.06 
 
 		 522 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  36.88 
 
 		 500 aa  259  9e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  38.4 
 
 		 500 aa  258  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  38.17 
 
 		 503 aa  257  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.55 
 
 		 519 aa  256  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  42.07 
 
 		 511 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  36.73 
 
 		 516 aa  253  5.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  37.23 
 
 		 500 aa  253  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  35.69 
 
 		 495 aa  252  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  41.24 
 
 		 514 aa  247  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  34.91 
 
 		 495 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  34.91 
 
 		 495 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  35.27 
 
 		 495 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  34.91 
 
 		 495 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  34.91 
 
 		 495 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  39.36 
 
 		 513 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  39.58 
 
 		 507 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.52 
 
 		 538 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.34 
 
 		 532 aa  241  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  39.03 
 
 		 502 aa  237  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.38 
 
 		 607 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 494 aa  235  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  40.39 
 
 		 501 aa  232  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.9 
 
 		 626 aa  232  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  38.64 
 
 		 501 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 519 aa  231  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47640  major facilitator transporter  40.3 
 
 		 501 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.899355 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3332  major facilitator superfamily MFS_1  39.35 
 
 		 515 aa  220  5e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.25944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>