More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1333 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1333  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 311 aa  590  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2594  thioredoxin domain-containing protein  46.04 
 
 		 339 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.238157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  50.36 
 
 		 337 aa  229  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2327  thioredoxin domain protein  44.27 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128937 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1092  Thioredoxin domain protein  50.34 
 
 		 310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.509026  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1730  putative thioredoxin domain-containing protein  45.06 
 
 		 313 aa  216  5e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10300  thioredoxin domain-containing protein  47.32 
 
 		 313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  46.02 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  46.18 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1282  Thioredoxin domain  47.71 
 
 		 319 aa  193  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00790933  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2422  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.86 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  45.54 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  43.77 
 
 		 312 aa  185  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0921  thioredoxin domain-containing protein  43.32 
 
 		 301 aa  185  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.460441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  45.21 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09500  thioredoxin domain-containing protein  39.35 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.460116  normal  0.88242 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  41.78 
 
 		 297 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1704  thioredoxin domain protein  43.18 
 
 		 310 aa  182  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  42.04 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6079  thioredoxin domain protein  44.49 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11356  thioredoxin  43.14 
 
 		 304 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3862  thioredoxin domain-containing protein  43.49 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3936  thioredoxin domain-containing protein  43.49 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3848  thioredoxin domain-containing protein  43.49 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2342  thioredoxin domain-containing protein  41.9 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299917  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  46.69 
 
 		 331 aa  159  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1804  thioredoxin domain-containing protein  39.56 
 
 		 314 aa  159  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  42.86 
 
 		 321 aa  155  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4303  thioredoxin domain-containing protein  41.27 
 
 		 297 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408854  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  41.3 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0364  putative thioredoxin  37.19 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1268  Thioredoxin domain protein  42.76 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19060  thioredoxin domain-containing protein  37.09 
 
 		 299 aa  145  8.000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.595284  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0139  hypothetical protein  31.53 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08240  thioredoxin domain-containing protein  40.19 
 
 		 324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2392  putative thioredoxin  39.23 
 
 		 309 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1117  thioredoxin-related protein  34.75 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3098  thioredoxin  43.27 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032408  hitchhiker  0.0000022841 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  31.77 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  30.61 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  32.59 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  30.89 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  31.49 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  32.28 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  31.33 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  35.07 
 
 		 280 aa  108  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  31.17 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  32.76 
 
 		 293 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  31.48 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  28.71 
 
 		 324 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  30.72 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  32.35 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  28.06 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  29.47 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  30.34 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  31.76 
 
 		 326 aa  102  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  27.7 
 
 		 334 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  32.21 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  32.21 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  34.55 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  29.97 
 
 		 312 aa  99.8  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  29.19 
 
 		 302 aa  99.8  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  33.57 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  29.55 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  29.71 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  29.87 
 
 		 306 aa  97.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  27.08 
 
 		 289 aa  95.5  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  27.08 
 
 		 289 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  27.36 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  27.08 
 
 		 289 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  27.52 
 
 		 330 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  30.04 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  27.37 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  45.28 
 
 		 282 aa  93.2  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  30.29 
 
 		 311 aa  93.2  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3007  Thioredoxin domain protein  27.3 
 
 		 286 aa  92.4  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3195  Thioredoxin domain protein  27.27 
 
 		 286 aa  92.4  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  31.58 
 
 		 280 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  27.06 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  34.57 
 
 		 286 aa  90.1  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  28.39 
 
 		 320 aa  90.5  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  28.93 
 
 		 281 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  34.02 
 
 		 285 aa  89.7  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  28.34 
 
 		 338 aa  89.4  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  30.9 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  29.87 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  26.32 
 
 		 281 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  31.5 
 
 		 235 aa  88.6  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  32.16 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  28.66 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  28.97 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  42.86 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  28.57 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  26.38 
 
 		 317 aa  87.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  24.92 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  29.87 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2665  thioredoxin-related  33.56 
 
 		 303 aa  87  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  29.08 
 
 		 287 aa  87  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  29.96 
 
 		 302 aa  86.7  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  29.15 
 
 		 289 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>