161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1252 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 		 1019 aa  2008    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  41.36 
 
 		 1018 aa  583  1.0000000000000001e-165  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  40.27 
 
 		 1331 aa  550  1e-155  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  35.48 
 
 		 1037 aa  522  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  38.98 
 
 		 1780 aa  520  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  40.31 
 
 		 1215 aa  515  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  38.43 
 
 		 1146 aa  501  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  33.45 
 
 		 1059 aa  483  1e-135  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  34.38 
 
 		 1041 aa  481  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  33.45 
 
 		 1059 aa  483  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  48.62 
 
 		 912 aa  456  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  32.62 
 
 		 1020 aa  451  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  49.41 
 
 		 690 aa  445  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  32.3 
 
 		 1242 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  33.7 
 
 		 1050 aa  340  5.9999999999999996e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.06 
 
 		 697 aa  331  3e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  33.33 
 
 		 689 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  32.21 
 
 		 1495 aa  309  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  41.72 
 
 		 1478 aa  277  6e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  30.16 
 
 		 619 aa  267  8e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  40.95 
 
 		 331 aa  263  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  40.53 
 
 		 366 aa  262  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  37.19 
 
 		 407 aa  245  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  29.68 
 
 		 756 aa  242  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  38.55 
 
 		 323 aa  239  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  39.44 
 
 		 374 aa  239  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  37.81 
 
 		 321 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  37.27 
 
 		 337 aa  231  4e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  38.1 
 
 		 359 aa  231  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  37.42 
 
 		 324 aa  225  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  38.71 
 
 		 338 aa  216  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  35.41 
 
 		 423 aa  213  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  36.75 
 
 		 491 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  34.99 
 
 		 837 aa  202  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  34.47 
 
 		 369 aa  201  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  40.82 
 
 		 477 aa  197  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  38.24 
 
 		 371 aa  195  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  41 
 
 		 333 aa  192  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  38.64 
 
 		 488 aa  192  4e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  32.48 
 
 		 370 aa  189  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  36.81 
 
 		 382 aa  188  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  35.51 
 
 		 678 aa  187  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  37.46 
 
 		 328 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  36.86 
 
 		 503 aa  184  8.000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  31.48 
 
 		 806 aa  181  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  39.39 
 
 		 474 aa  181  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  35.87 
 
 		 815 aa  181  7e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  27.51 
 
 		 1077 aa  180  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  39.7 
 
 		 543 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  36.99 
 
 		 457 aa  179  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  35.62 
 
 		 490 aa  176  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  31.95 
 
 		 2457 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  34.26 
 
 		 487 aa  176  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  37.05 
 
 		 399 aa  172  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  32.55 
 
 		 423 aa  172  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  35.8 
 
 		 619 aa  171  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  34.87 
 
 		 465 aa  170  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  37.75 
 
 		 1001 aa  170  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  34.68 
 
 		 347 aa  168  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  33.86 
 
 		 778 aa  167  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  35.11 
 
 		 497 aa  167  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  34.34 
 
 		 347 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  35.76 
 
 		 309 aa  163  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  36.31 
 
 		 388 aa  163  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  36.75 
 
 		 383 aa  161  6e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  34.6 
 
 		 820 aa  161  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  32.92 
 
 		 373 aa  160  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  37.84 
 
 		 454 aa  159  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  31.29 
 
 		 364 aa  158  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  36 
 
 		 317 aa  157  8e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  35.56 
 
 		 472 aa  157  9e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  35.87 
 
 		 451 aa  155  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  34.11 
 
 		 376 aa  153  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  33.23 
 
 		 495 aa  152  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  36.3 
 
 		 375 aa  153  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  34.67 
 
 		 474 aa  152  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  34.2 
 
 		 389 aa  150  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  32.63 
 
 		 628 aa  150  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  37.42 
 
 		 451 aa  150  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  30.56 
 
 		 463 aa  148  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  36.45 
 
 		 394 aa  147  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  34.19 
 
 		 756 aa  146  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  35.02 
 
 		 457 aa  146  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  30.51 
 
 		 357 aa  145  6e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  35.88 
 
 		 398 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  34.38 
 
 		 829 aa  142  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  25.15 
 
 		 639 aa  139  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  35.67 
 
 		 370 aa  137  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  33.86 
 
 		 401 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  32.88 
 
 		 357 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  32.36 
 
 		 357 aa  132  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  47.24 
 
 		 1422 aa  131  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2793  glycoside hydrolase family 10  31.29 
 
 		 561 aa  128  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0410963 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  31.95 
 
 		 370 aa  126  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  27.97 
 
 		 387 aa  126  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  32.83 
 
 		 368 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  46.85 
 
 		 1427 aa  122  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26810  beta-1,4-xylanase  30.79 
 
 		 566 aa  122  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  32.57 
 
 		 373 aa  121  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  27.09 
 
 		 520 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>