112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1237 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1237  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  599  1e-170  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3288  hypothetical protein  34.34 
 
 
313 aa  132  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3541  hypothetical protein  34.38 
 
 
347 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000177029  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5135  hypothetical protein  35.03 
 
 
306 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4722  hypothetical protein  33.55 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  39.29 
 
 
330 aa  117  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1165  hypothetical protein  33.89 
 
 
302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000066316 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03080  hypothetical protein  35.94 
 
 
313 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  37.35 
 
 
259 aa  105  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1395  hypothetical protein  33.62 
 
 
328 aa  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0744184  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2611  hypothetical protein  29.74 
 
 
319 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285658 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18420  hypothetical protein  32.03 
 
 
306 aa  102  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056172  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0019  hypothetical protein  34.43 
 
 
317 aa  100  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0256854  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1754  hypothetical protein  32.93 
 
 
299 aa  99.8  5e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.133696  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2902  hypothetical protein  30.87 
 
 
319 aa  99.4  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5229  hypothetical protein  36.72 
 
 
291 aa  97.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  34.4 
 
 
289 aa  93.6  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1533  hypothetical protein  30.35 
 
 
302 aa  92.8  6e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.837222  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28800  hypothetical protein  30.5 
 
 
379 aa  89.7  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  36.42 
 
 
277 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20040  hypothetical protein  32.58 
 
 
316 aa  86.3  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  35.76 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  35.76 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3163  hypothetical protein  31.85 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  36.46 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0068  hypothetical protein  32.29 
 
 
276 aa  81.6  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02360  hypothetical protein  31.34 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81063  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01230  hypothetical protein  32.02 
 
 
355 aa  77  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  30.61 
 
 
295 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  31.73 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  31.73 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  32.58 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  31.73 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  34.74 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  34.39 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  34.39 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  33.12 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21980  hypothetical protein  36.48 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  33.99 
 
 
357 aa  72.8  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  36.48 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4733  hypothetical protein  32.63 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.545142  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  30 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27230  hypothetical protein  35.86 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  30 
 
 
284 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  30 
 
 
284 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  29.8 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  33.93 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15480  hypothetical protein  31.47 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.44382  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  30.12 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  30.12 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0898  hypothetical protein  42.16 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  32.44 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4353  hypothetical protein  32.28 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4439  hypothetical protein  32.28 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31030  hypothetical protein  30.84 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  34.86 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  34.86 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  28.49 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  31.01 
 
 
278 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  27.4 
 
 
289 aa  62.8  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  29.84 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  32.42 
 
 
321 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18620  hypothetical protein  30.77 
 
 
329 aa  61.6  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178834  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  33.14 
 
 
289 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4792  hypothetical protein  32.42 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  29.73 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  32.81 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  25.77 
 
 
290 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  32.81 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  25.77 
 
 
290 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  32.81 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  25.77 
 
 
290 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  33.33 
 
 
294 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  29.24 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16560  hypothetical protein  33.54 
 
 
325 aa  58.5  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  29.67 
 
 
306 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2878  hypothetical protein  40.78 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5526  hypothetical protein  30.17 
 
 
298 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1656  hypothetical protein  30.81 
 
 
294 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1976  hypothetical protein  30.04 
 
 
336 aa  56.2  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000667209 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0434  hypothetical protein  25.45 
 
 
289 aa  55.8  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  31.98 
 
 
281 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  31.98 
 
 
281 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  28 
 
 
374 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1730  hypothetical protein  29.57 
 
 
288 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432935  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04300  hypothetical protein  35.85 
 
 
319 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.169884  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  31.4 
 
 
281 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  28.4 
 
 
295 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4443  hypothetical protein  28.51 
 
 
291 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4530  hypothetical protein  28.51 
 
 
291 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.724398  normal  0.679375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  29.11 
 
 
339 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  30.28 
 
 
307 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  30.49 
 
 
262 aa  50.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  30.7 
 
 
301 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  36.94 
 
 
289 aa  50.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0677  hypothetical protein  30.57 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3034  hypothetical protein  27.98 
 
 
313 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3899  hypothetical protein  31.71 
 
 
289 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  28.72 
 
 
320 aa  47  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0191  hypothetical protein  25.14 
 
 
231 aa  46.2  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>