20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1186 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1186  putative integral membrane protein  100 
 
 		 340 aa  664    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1372  hypothetical protein  34.53 
 
 		 308 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0439  hypothetical protein  37.21 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4294  putative integral membrane protein  40.66 
 
 		 348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5183  hypothetical protein  36.12 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4083  hypothetical protein  34.17 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1370  hypothetical protein  34.47 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2521  hypothetical protein  37.63 
 
 		 297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7625  putative integral membrane protein  33.55 
 
 		 451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.371548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0743  hypothetical protein  37.75 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3773  hypothetical protein  36.62 
 
 		 318 aa  126  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.761879  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0741  hypothetical protein  35.56 
 
 		 320 aa  126  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133882 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1327  hypothetical protein  41.23 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.299611  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2359  hypothetical protein  36.68 
 
 		 316 aa  97.1  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.986223  hitchhiker  0.00967269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3864  hypothetical protein  37.72 
 
 		 323 aa  86.7  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2552  hypothetical protein  33.5 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1960  hypothetical protein  25.98 
 
 		 316 aa  47  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222208 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2122  hypothetical protein  25.66 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2689  hypothetical protein  20.46 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3850  hypothetical protein  21.43 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>