More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1166 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1166  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  100 
 
 		 395 aa  772    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1167  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  45.41 
 
 		 417 aa  317  3e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2594  cell envelope-related transcriptional attenuator  48.02 
 
 		 442 aa  292  8e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08570  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  46.5 
 
 		 365 aa  287  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.671315  normal  0.595892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08580  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  45.87 
 
 		 396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.393457 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2383  cell envelope-related transcriptional attenuator  44.41 
 
 		 389 aa  252  8.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0868762  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  45.54 
 
 		 506 aa  246  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1864  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.06 
 
 		 391 aa  233  6e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.383316  normal  0.036217 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0784  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.29 
 
 		 400 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1025  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.18 
 
 		 434 aa  229  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7619  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.99 
 
 		 379 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  43.69 
 
 		 468 aa  227  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3844  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  40.66 
 
 		 373 aa  225  8e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.95 
 
 		 478 aa  222  8e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  43.97 
 
 		 481 aa  222  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30000  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  40.18 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0624  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.3 
 
 		 481 aa  210  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3214  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.02 
 
 		 443 aa  205  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1363  Transcriptional regulator-like protein  39.46 
 
 		 530 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.43 
 
 		 618 aa  202  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2956  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.32 
 
 		 453 aa  202  8e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1026  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.42 
 
 		 402 aa  202  9e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.999724  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4096  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.69 
 
 		 468 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3302  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.86 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0589  putative transcriptional regulator  34.66 
 
 		 498 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.581304 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.46 
 
 		 584 aa  196  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0934  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.01 
 
 		 480 aa  193  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0202033 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0411  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.5 
 
 		 520 aa  192  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.118906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.64 
 
 		 509 aa  190  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7618  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.47 
 
 		 643 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.16 
 
 		 497 aa  186  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1248  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.44 
 
 		 512 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00540  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  42.69 
 
 		 357 aa  182  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.916603  normal  0.105126 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0935  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.39 
 
 		 465 aa  173  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0761113 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37600  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  35.63 
 
 		 619 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4976  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.53 
 
 		 551 aa  170  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7541  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.23 
 
 		 540 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0412  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.26 
 
 		 491 aa  162  9e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2228  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.08 
 
 		 521 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000756142  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3496  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.48 
 
 		 486 aa  161  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.625789  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4114  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.13 
 
 		 549 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  36.16 
 
 		 505 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.57 
 
 		 390 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.14 
 
 		 504 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1965  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.47 
 
 		 487 aa  155  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000312518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4529  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.2 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6814  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.64 
 
 		 1336 aa  152  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5087  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.95 
 
 		 687 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10837  hypothetical protein  35.91 
 
 		 684 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372154 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1666  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.79 
 
 		 649 aa  150  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0126  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.82 
 
 		 499 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  33.45 
 
 		 734 aa  143  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.08 
 
 		 409 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.56 
 
 		 573 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4513  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.94 
 
 		 699 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4600  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.94 
 
 		 699 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4896  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.16 
 
 		 701 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5418  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.66 
 
 		 311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5038  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.66 
 
 		 311 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5126  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.66 
 
 		 311 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  36.47 
 
 		 349 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5205  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.26 
 
 		 560 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0714783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5665  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.42 
 
 		 306 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.0393509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.84 
 
 		 414 aa  132  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.18 
 
 		 625 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.28 
 
 		 516 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.98 
 
 		 393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.85 
 
 		 336 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08920  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  34.06 
 
 		 381 aa  129  7.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6349  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.88 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.83 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  34.77 
 
 		 420 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.49 
 
 		 495 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6386  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.2 
 
 		 382 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.61 
 
 		 362 aa  124  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.83 
 
 		 545 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1061  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.52 
 
 		 567 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.12 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2567  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.81 
 
 		 404 aa  119  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.85 
 
 		 521 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3901  cell envelope-related transcriptional attenuator  36 
 
 		 407 aa  116  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120062 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08290  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.81 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154905  normal  0.235154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1037  cell envelope-related transcriptional attenuator  29 
 
 		 732 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0136  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.01 
 
 		 466 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8771  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.07 
 
 		 547 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.47 
 
 		 307 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08810  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  34.04 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.155806  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28900  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  29.54 
 
 		 522 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.385343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0120  Transcriptional regulator-like protein  34.39 
 
 		 326 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5903  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.8 
 
 		 508 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.667474 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.49 
 
 		 322 aa  111  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3228  cell envelope-related transcriptional attenuator  32 
 
 		 377 aa  110  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0471557  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1808  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.33 
 
 		 424 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292903  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0172  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  34.82 
 
 		 307 aa  109  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0711  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.84 
 
 		 526 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1996  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.34 
 
 		 527 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1296  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.04 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1865  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.25 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0368682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1318  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.05 
 
 		 490 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.940107  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.08 
 
 		 563 aa  107  4e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.234515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>