More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1152 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  80.04 
 
 
531 aa  846    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  64.46 
 
 
516 aa  664    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  68.07 
 
 
551 aa  712    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  68.76 
 
 
537 aa  754    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  66.48 
 
 
548 aa  706    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  71.59 
 
 
534 aa  774    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  68.14 
 
 
531 aa  721    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  68.01 
 
 
527 aa  734    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  71.51 
 
 
536 aa  758    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  72.35 
 
 
543 aa  773    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  71.54 
 
 
546 aa  775    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  73.26 
 
 
530 aa  783    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  69.87 
 
 
524 aa  756    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  72.02 
 
 
529 aa  781    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  64.39 
 
 
556 aa  703    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  62 
 
 
550 aa  640    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  64.34 
 
 
516 aa  660    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  78.83 
 
 
526 aa  866    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  67.82 
 
 
527 aa  724    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  71.05 
 
 
552 aa  756    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  72.36 
 
 
529 aa  773    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  62.84 
 
 
516 aa  657    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  64.9 
 
 
549 aa  693    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  83.5 
 
 
542 aa  861    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  70.06 
 
 
540 aa  767    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1311  carboxyl transferase  64.39 
 
 
556 aa  703    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0791098  normal  0.306854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  70.61 
 
 
536 aa  759    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  64.51 
 
 
542 aa  700    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  82.33 
 
 
532 aa  899    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  73.51 
 
 
530 aa  779    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  70.86 
 
 
541 aa  750    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  64.39 
 
 
556 aa  703    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  67.42 
 
 
534 aa  696    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  72.17 
 
 
527 aa  766    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  100 
 
 
529 aa  1066    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  66.54 
 
 
527 aa  714    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  65.06 
 
 
538 aa  709    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  68.5 
 
 
542 aa  726    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  71.62 
 
 
527 aa  774    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  59.24 
 
 
522 aa  631  1e-180  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  60.58 
 
 
513 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  59.92 
 
 
518 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  56.4 
 
 
516 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  56.81 
 
 
516 aa  601  1.0000000000000001e-171  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  57.2 
 
 
531 aa  604  1.0000000000000001e-171  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  58.68 
 
 
520 aa  601  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  56.02 
 
 
528 aa  592  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  58.15 
 
 
508 aa  592  1e-168  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  55.21 
 
 
514 aa  594  1e-168  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  58 
 
 
520 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  57.45 
 
 
515 aa  590  1e-167  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  54.74 
 
 
516 aa  590  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  58 
 
 
519 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  58 
 
 
519 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  56.14 
 
 
516 aa  587  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  56.67 
 
 
515 aa  586  1e-166  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  57.17 
 
 
510 aa  586  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  58 
 
 
519 aa  588  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  56.94 
 
 
517 aa  580  1e-164  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  55.69 
 
 
513 aa  578  1e-164  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  54.02 
 
 
519 aa  578  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  55.32 
 
 
516 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  56.29 
 
 
510 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  55.13 
 
 
516 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  55.32 
 
 
516 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  56.48 
 
 
510 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  54.42 
 
 
517 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  57.95 
 
 
510 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  56.29 
 
 
510 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  55.91 
 
 
512 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1401  carboxyl transferase  56.07 
 
 
510 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0947587  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  57.95 
 
 
510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  55.51 
 
 
531 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  55.8 
 
 
510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3787  Propionyl-CoA carboxylase  55.23 
 
 
510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  56.01 
 
 
510 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  53.28 
 
 
513 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  53.93 
 
 
516 aa  574  1.0000000000000001e-162  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  57.95 
 
 
510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0437  carboxyl transferase  52.4 
 
 
509 aa  568  1e-161  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.137321  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1579  carboxyl transferase  55.88 
 
 
523 aa  570  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0377813  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  52.44 
 
 
513 aa  570  1e-161  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  56.94 
 
 
510 aa  571  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5024  putative propionyl-CoA carboxylase beta chain  55.62 
 
 
510 aa  571  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.541202 
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  52.52 
 
 
508 aa  567  1e-160  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  55.13 
 
 
514 aa  566  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  55.98 
 
 
517 aa  567  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  56.94 
 
 
510 aa  565  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  55.49 
 
 
513 aa  568  1e-160  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  56.74 
 
 
510 aa  565  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  55.11 
 
 
510 aa  566  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  53.61 
 
 
518 aa  565  1e-160  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5659  carboxyl transferase  55.15 
 
 
510 aa  567  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  55.82 
 
 
511 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  55.94 
 
 
510 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  56.54 
 
 
510 aa  562  1.0000000000000001e-159  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3122  carboxyl transferase  56.14 
 
 
510 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629263  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  54.53 
 
 
514 aa  563  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  54.58 
 
 
514 aa  563  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  54.74 
 
 
510 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>