More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1090 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  413  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  43.5 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  42.49 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  41.29 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 194 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  40.44 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  33.67 
 
 		 199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 205 aa  107  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  37.56 
 
 		 202 aa  107  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 205 aa  95.1  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  31.07 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 212 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  32.97 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  30.34 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  30.34 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  30.34 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  30.34 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  30.34 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  30.34 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  30.34 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  32.09 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  32.32 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  34.91 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  33.6 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  58.82 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  29.51 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1333  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1971  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000614274  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  54 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 247 aa  58.2  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 247 aa  58.2  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  24.69 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  50 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  50 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3834  transcriptional regulator, TetR family  23.94 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  48.08 
 
 		 278 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 497 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>