149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1004 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1004  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 514 aa  980    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0175607 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  47.02 
 
 		 497 aa  389  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  44.51 
 
 		 510 aa  364  2e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  44.51 
 
 		 510 aa  364  2e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  44.16 
 
 		 575 aa  317  2e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02920  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  48.16 
 
 		 502 aa  310  5.9999999999999995e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2893  polysaccharide biosynthesis protein  35.73 
 
 		 500 aa  244  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  33.82 
 
 		 503 aa  219  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  30.89 
 
 		 507 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  39.08 
 
 		 514 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  31.91 
 
 		 508 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  34.96 
 
 		 509 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  32.93 
 
 		 487 aa  202  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  32.99 
 
 		 504 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  32.99 
 
 		 504 aa  196  9e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  33.01 
 
 		 501 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  33.07 
 
 		 501 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  31.49 
 
 		 504 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  33.25 
 
 		 501 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  29.84 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  28.67 
 
 		 493 aa  148  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 		 487 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 		 490 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.3 
 
 		 476 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  27.21 
 
 		 483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  29.86 
 
 		 480 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  27.71 
 
 		 475 aa  127  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 482 aa  121  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 487 aa  121  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  22.06 
 
 		 474 aa  117  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  22.06 
 
 		 475 aa  117  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  26.93 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  24.34 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  27.95 
 
 		 486 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  19.54 
 
 		 477 aa  110  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  23.11 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  23.91 
 
 		 510 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  23.91 
 
 		 510 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  28.54 
 
 		 515 aa  107  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  23.91 
 
 		 510 aa  107  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  23.91 
 
 		 503 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  23.91 
 
 		 510 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  29.05 
 
 		 502 aa  106  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  25.75 
 
 		 484 aa  106  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  23.16 
 
 		 483 aa  106  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  23.43 
 
 		 492 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  23.25 
 
 		 492 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  23.19 
 
 		 492 aa  105  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  22.38 
 
 		 492 aa  104  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  23.19 
 
 		 492 aa  105  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  23.43 
 
 		 492 aa  104  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  31.75 
 
 		 493 aa  103  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  23.43 
 
 		 492 aa  103  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  23.43 
 
 		 492 aa  103  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  23.51 
 
 		 479 aa  103  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  28.82 
 
 		 502 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  27.17 
 
 		 488 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  27.44 
 
 		 497 aa  102  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2706  polysaccharide biosynthesis protein  29.44 
 
 		 510 aa  102  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  29.75 
 
 		 500 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  30.07 
 
 		 503 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3544  polysaccharide biosynthesis protein  27.84 
 
 		 530 aa  101  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  25.07 
 
 		 483 aa  99.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  27.53 
 
 		 484 aa  97.4  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 471 aa  97.1  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0892  polysaccharide biosynthesis protein  32.24 
 
 		 484 aa  96.3  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  25.08 
 
 		 492 aa  95.1  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  26.12 
 
 		 505 aa  94  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1055  hypothetical protein  27.17 
 
 		 508 aa  93.6  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 		 421 aa  92.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.71 
 
 		 508 aa  90.9  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  22.98 
 
 		 487 aa  90.9  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  30.06 
 
 		 500 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  26.4 
 
 		 509 aa  89.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  27.89 
 
 		 488 aa  88.6  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  27.97 
 
 		 503 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  26.11 
 
 		 497 aa  87.4  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  28.31 
 
 		 490 aa  87  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1083  polysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 		 484 aa  86.7  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.945146  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  26.03 
 
 		 499 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  25.65 
 
 		 498 aa  85.5  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  26.77 
 
 		 520 aa  85.5  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 		 508 aa  85.1  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  25.49 
 
 		 504 aa  84.7  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  27.06 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 472 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3839  polysaccharide biosynthesis protein  22.95 
 
 		 507 aa  83.2  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 502 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  27.16 
 
 		 482 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 		 448 aa  80.1  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1190  polysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 		 490 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 		 488 aa  79  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 		 494 aa  77  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  22.74 
 
 		 492 aa  77  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2888  polysaccharide biosynthesis protein  25.24 
 
 		 494 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0315028 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  25.95 
 
 		 512 aa  75.1  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8492  polysaccharide biosynthesis protein  27.43 
 
 		 533 aa  73.9  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3348  polysaccharide biosynthesis protein  27.04 
 
 		 502 aa  73.9  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  27.51 
 
 		 467 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>