More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0982 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0982  ABC transporter related  100 
 
 
295 aa  578  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  54.04 
 
 
295 aa  278  8e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  56.27 
 
 
294 aa  276  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  53.02 
 
 
297 aa  269  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1344  ABC transporter related  51.61 
 
 
309 aa  260  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331631  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2228  ABC transporter related protein  48.62 
 
 
287 aa  240  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367776  hitchhiker  0.00839495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8885  ABC transporter related  44.71 
 
 
281 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2306  ABC transporter related  42.61 
 
 
296 aa  202  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000106852  hitchhiker  0.000394376 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3574  ABC transporter related  41.99 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034962  hitchhiker  0.00545228 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6370  ABC transporter related  42.96 
 
 
283 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 
284 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  31.72 
 
 
287 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3778  ABC transporter-related protein  38.82 
 
 
283 aa  155  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0059  ABC transporter related  41.07 
 
 
287 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0437  ABC transporter  31.72 
 
 
287 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.595645  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  36.07 
 
 
298 aa  153  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0076  ABC transporter related  38.11 
 
 
287 aa  153  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0078  ABC transporter related  38.11 
 
 
287 aa  153  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000932983 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0074  ABC transporter related  38.11 
 
 
287 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0073  ABC transporter, ATP-binding protein  37.36 
 
 
287 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  35.9 
 
 
280 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0073  ABC transporter related  37.45 
 
 
287 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0078  ABC transporter related  36.92 
 
 
287 aa  148  8e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  30.7 
 
 
290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4444  ABC transporter ATP-binding protein  30.7 
 
 
290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000946464  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0070  ABC transporter related  40.55 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4276  ABC transporter related  36.92 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4241  ABC transporter, ATP-binding protein  30.7 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  30.7 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0075  ABC transporter related  38.81 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4076  ABC transporter related  30.13 
 
 
290 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  30.09 
 
 
290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4188  ABC transporter related  36.44 
 
 
280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4298  ABC transporter, ATP-binding protein  30.23 
 
 
290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000106879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  30.23 
 
 
290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4352  ABC transporter, ATP-binding protein  30.23 
 
 
290 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000295734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4332  ABC transporter, ATP-binding protein  29.77 
 
 
290 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1164  ABC transporter related  34.7 
 
 
302 aa  142  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328478  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  28.11 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  32.89 
 
 
313 aa  138  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0849  ABC transporter related  39.13 
 
 
301 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0333134 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1990  ABC transporter related  29.31 
 
 
298 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2023  ABC transporter related  29.31 
 
 
298 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3975  ABC transporter related  36.61 
 
 
289 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  31.16 
 
 
286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0963  ABC transporter related  32.59 
 
 
284 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.63233  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1901  ABC transporter, ATP-binding protein  25.66 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1477  ABC transporter, ATP-binding protein  29.17 
 
 
304 aa  134  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.106136  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0790  multidrug ABC transporter ATPase  31.92 
 
 
306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0445  ATPase  36.41 
 
 
295 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  33.77 
 
 
304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  33.33 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  38.61 
 
 
909 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  36.77 
 
 
332 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  31.43 
 
 
233 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2604  ABC transporter, ATP-binding protein  35.98 
 
 
307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2163  ABC transporter, ATP-binding protein  30.53 
 
 
288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2233  ABC transporter related  35.98 
 
 
307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  41.1 
 
 
300 aa  129  7.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  34.24 
 
 
307 aa  129  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  30.97 
 
 
288 aa  129  9.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1530  ABC transporter related  31.94 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.653437  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  27.7 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0223  ABC transporter related  25.93 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.862249  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  30.69 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1403  ABC transporter ATP-binding protein  30.14 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.474757  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  31.31 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1574  ABC transporter related  35.58 
 
 
301 aa  126  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000043454  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  32.09 
 
 
314 aa  126  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1982  ABC transporter ATP-binding protein  30.09 
 
 
288 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0191587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2130  ABC transporter ATP-binding protein  30.09 
 
 
288 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.718107  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  36.62 
 
 
320 aa  125  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1628  ABC transporter related  30.14 
 
 
233 aa  125  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.134998 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.6 
 
 
302 aa  125  9e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3988  ABC transporter ATP-binding protein  33.66 
 
 
293 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0992  ABC transporter related protein  31.25 
 
 
230 aa  124  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0675  ABC transporter related  34.08 
 
 
285 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4299  ABC transporter ATP-binding protein  33.66 
 
 
293 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.170218  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0518  ABC transporter related protein  37.44 
 
 
248 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1620  ABC transporter related  32.68 
 
 
232 aa  124  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  30.09 
 
 
293 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1167  ABC transporter related  38.05 
 
 
232 aa  124  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  0.478862 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  35.02 
 
 
298 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  31.25 
 
 
313 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1514  ABC transporter related  29.22 
 
 
234 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  33.33 
 
 
299 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  31.47 
 
 
308 aa  123  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  33.93 
 
 
335 aa  123  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  35.56 
 
 
253 aa  123  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  32.62 
 
 
310 aa  122  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4099  ABC transporter, ATP-binding protein  33.5 
 
 
293 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52273e-30 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  27.48 
 
 
232 aa  122  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  39.44 
 
 
303 aa  122  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0372  ABC transporter related  29.73 
 
 
265 aa  122  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  41.15 
 
 
337 aa  122  9e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2276  ABC transporter related  29.33 
 
 
282 aa  122  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0277035  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  33 
 
 
323 aa  122  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  34.7 
 
 
230 aa  122  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1367  ABC transporter related  41.26 
 
 
254 aa  122  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.181085  normal  0.116332 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  31.82 
 
 
340 aa  122  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>