More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0895 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
300 aa  593  1e-168  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  0.306181 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18870  carbohydrate ABC transporter membrane protein  67.31 
 
 
319 aa  412  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.858818  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.38 
 
 
307 aa  372  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.556058 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.15 
 
 
301 aa  333  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0210527 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.39 
 
 
304 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.09 
 
 
284 aa  295  5e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  50.69 
 
 
304 aa  289  4e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.45 
 
 
297 aa  265  5e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.33 
 
 
296 aa  251  9.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.982521  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.21 
 
 
277 aa  251  9.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30850  ABC-type sugar transport system, permease component  44.31 
 
 
315 aa  248  7e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.01 
 
 
307 aa  247  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.68 
 
 
303 aa  241  9e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12849  sn-glycerol-3-phosphate transport integral membrane protein ABC transporter ugpE  44.7 
 
 
275 aa  235  6e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144305  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.7 
 
 
299 aa  235  8e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0163331  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.18 
 
 
299 aa  232  7.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.79 
 
 
311 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  37.16 
 
 
277 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  37.16 
 
 
277 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
270 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
301 aa  179  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  36.02 
 
 
275 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.89 
 
 
291 aa  179  4.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
274 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
279 aa  178  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.67338  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
271 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
298 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.12 
 
 
270 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0719  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
279 aa  176  6e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.74 
 
 
295 aa  175  8e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.45 
 
 
273 aa  175  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0553602  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1482  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.54 
 
 
272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00114182  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.74 
 
 
268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.353997  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.54 
 
 
308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0605  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 
273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4734  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 
273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
290 aa  172  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
284 aa  172  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.74 
 
 
722 aa  172  5.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0626826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0631  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  33.08 
 
 
273 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0479  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  33.46 
 
 
273 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0481  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  33.46 
 
 
273 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0699  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  33.08 
 
 
273 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0624  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 
273 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0537  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease  33.46 
 
 
273 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  37.11 
 
 
273 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0568  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease protein  33.46 
 
 
273 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  35.4 
 
 
272 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.02 
 
 
310 aa  170  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
272 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.67 
 
 
302 aa  170  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
280 aa  169  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
272 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0383  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
268 aa  169  8e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
270 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
271 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
275 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  31.03 
 
 
286 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1458  ABC-type sugar transport system, permease component  35.71 
 
 
276 aa  167  2.9999999999999998e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0320  monosaccharide-transporting ATPase  34.88 
 
 
701 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 
406 aa  166  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0947722  normal  0.449211 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
270 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0376  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  34.43 
 
 
281 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01230  ABC-type sugar transport system, permease component  35.25 
 
 
307 aa  165  6.9999999999999995e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0175  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.43 
 
 
278 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2050  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.17 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
275 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0325  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  34.43 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0300  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  34.43 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
281 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  hitchhiker  0.00173435 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.342174  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2710  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  34.43 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0316  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  34.07 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0397  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  34.43 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  34.98 
 
 
269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.36 
 
 
276 aa  163  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.99 
 
 
299 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
298 aa  163  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2023  Monosaccharide-transporting ATPase  34.09 
 
 
295 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
277 aa  163  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
285 aa  163  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3652  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
283 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0857223  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2301  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
285 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.866945  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.70012 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5330  ABC transporter  33.7 
 
 
274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  35.29 
 
 
276 aa  162  6e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
291 aa  162  7e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0439942  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0338  monosaccharide-transporting ATPase  34.88 
 
 
701 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
282 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110391  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.55 
 
 
295 aa  162  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0446  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  36.18 
 
 
281 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152206  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3494  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  36.59 
 
 
281 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  31.32 
 
 
277 aa  161  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.39 
 
 
291 aa  161  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>