More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0881 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0881  citrate synthase 2  100 
 
 
351 aa  677    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10908  citrate synthase 2  55.7 
 
 
373 aa  319  3e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5025  citrate synthase 2  54.75 
 
 
371 aa  318  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0511  citrate synthase 2  52.38 
 
 
368 aa  316  4e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.043222  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1262  Citrate (Si)-synthase  52.85 
 
 
375 aa  311  7.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0830  Citrate (Si)-synthase  54.29 
 
 
374 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0509  citrate synthase 2  54.74 
 
 
371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1726  citrate synthase 2  55.06 
 
 
373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0423  citrate synthase 2  53.02 
 
 
368 aa  306  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4459  citrate synthase 2  54.75 
 
 
376 aa  302  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4546  citrate synthase 2  54.75 
 
 
376 aa  302  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal  0.862054 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4841  citrate synthase 2  54.75 
 
 
376 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33820  citrate synthase 2  51.68 
 
 
389 aa  296  3e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1005  Citrate (Si)-synthase  49.85 
 
 
368 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7229  citrate synthase 2  54.6 
 
 
364 aa  294  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0848  Citrate (Si)-synthase  51.63 
 
 
368 aa  294  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8787  citrate synthase 2  52.12 
 
 
378 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.901315 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0733  citrate synthase 2  48.78 
 
 
368 aa  290  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1016  Citrate (Si)-synthase  50.79 
 
 
366 aa  288  7e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  hitchhiker  0.00235766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0520  citrate (Si)-synthase  49.85 
 
 
368 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.341938  normal  0.0162418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0834  Citrate (Si)-synthase  49.24 
 
 
377 aa  287  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0081  citrate synthase 2  53.52 
 
 
369 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0115  citrate synthase 2  51.99 
 
 
368 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0247  citrate synthase 2  49.85 
 
 
368 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5814  Citrate (Si)-synthase  52.73 
 
 
361 aa  273  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00482398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4708  citrate synthase 2  48.25 
 
 
370 aa  248  8e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3748  Citrate (Si)-synthase  35.22 
 
 
388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3561  Citrate (Si)-synthase  33.75 
 
 
387 aa  139  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6150  Citrate (Si)-synthase  32.21 
 
 
391 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.153659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3093  Citrate (Si)-synthase  30.43 
 
 
378 aa  125  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.832749 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  29.36 
 
 
387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  30.84 
 
 
378 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  29.61 
 
 
375 aa  115  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  29.61 
 
 
375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  38.89 
 
 
395 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  28.45 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  29.12 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  29.12 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  28.45 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  26.38 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4948  citrate synthase 2  35.31 
 
 
364 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257238  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1729  Citrate (Si)-synthase  32.13 
 
 
373 aa  109  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120294  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0281  citrate synthase  26.16 
 
 
378 aa  109  7.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.160338  normal  0.143922 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  28.82 
 
 
381 aa  109  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0730  citrate synthase  26.67 
 
 
398 aa  108  2e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.554862  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2420  Citrate synthase  28.16 
 
 
481 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  26.7 
 
 
391 aa  107  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  32.66 
 
 
429 aa  105  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  32.66 
 
 
429 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2141  Citrate (Si)-synthase  34.11 
 
 
389 aa  105  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.636674  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0841  type II citrate synthase  32.26 
 
 
429 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1366  citrate synthase  27.3 
 
 
423 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1370  citrate synthase  27.3 
 
 
423 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.53 
 
 
385 aa  103  6e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1151  citrate synthase  27.38 
 
 
416 aa  102  7e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00353381  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  28.18 
 
 
429 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.33 
 
 
430 aa  102  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  28.18 
 
 
429 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  28.18 
 
 
429 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  28.18 
 
 
429 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  33 
 
 
431 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2557  citrate synthase  36.68 
 
 
391 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  25.66 
 
 
374 aa  102  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  27.93 
 
 
429 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1729  type II citrate synthase  28.61 
 
 
434 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  27.78 
 
 
434 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3253  type II citrate synthase  28.07 
 
 
425 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0106  citrate synthase I  34.24 
 
 
426 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  27.78 
 
 
434 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  27.78 
 
 
434 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  34.04 
 
 
429 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  34.04 
 
 
429 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0097  citrate synthase  34.24 
 
 
426 aa  100  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0802276  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  28.74 
 
 
381 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3105  type II citrate synthase  25.83 
 
 
428 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.510334  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  25.22 
 
 
375 aa  100  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1678  type II citrate synthase  31.14 
 
 
431 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0407476  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.41 
 
 
380 aa  100  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  28.03 
 
 
386 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0586  citrate synthase  25.35 
 
 
430 aa  100  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  28.03 
 
 
386 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  28.87 
 
 
396 aa  100  5e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  35.29 
 
 
427 aa  100  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0260  citrate synthase I  32.29 
 
 
426 aa  100  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.419168  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0124  citrate synthase I  26.68 
 
 
416 aa  99.8  6e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.559249  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  33.15 
 
 
436 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01870  Citrate synthase  30.26 
 
 
425 aa  99.4  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2214  citrate synthase I  31.65 
 
 
428 aa  98.6  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1139  type II citrate synthase  26.4 
 
 
428 aa  99  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  28.65 
 
 
397 aa  98.6  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2111  citrate synthase  31.19 
 
 
454 aa  99  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000226419  normal  0.855626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7568  citrate synthase 2  39.59 
 
 
362 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.708852 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2919  type II citrate synthase  25 
 
 
428 aa  99  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  34.07 
 
 
378 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1379  type II citrate synthase  25.41 
 
 
426 aa  97.8  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000415607  normal  0.279105 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  27.98 
 
 
442 aa  98.6  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2973  type II citrate synthase  25.41 
 
 
426 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00618343  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2886  type II citrate synthase  25.41 
 
 
426 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000035086  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.8 
 
 
382 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5022  type II citrate synthase  28.1 
 
 
434 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.834357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>